排序
聚类分析-HBC lesson 7
学习内容 学会选择合适的PCs用于聚类分析 聚类的方法 目标 产生细胞类型特异性聚类,并使用已知的细胞类型标记基因来确定聚类的身份。 确定集群是否代表真正的细胞类型或由于生物或技术差异而产...
Nature Genetics:主动脉瓣功能及主动脉瓣狭窄风险相关遗传变异的多性状分析研究
本研究致力于探讨主动脉瓣功能及其与主动脉瓣狭窄(AS)风险相关的遗传变异。通过对UK Biobank中62902名参与者进行相差心血管磁共振成像(cMRI),结合深度学习技术,自动提取了三项关键的生理...
Seurat基本分析流程
参考链接: https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial.html 建立 Seurat 对象 示例数据为10X Genomics的外周血单个核细胞(PBMC)数据集,含有2700个单细胞,使用Illumina NextSeq...
使用singleR预测细胞类型
SingleR是用于单细胞RNA测序(scRNAseq)数据的自动注释方法(Aran et al.2019)。给定具有已知标签的样本(单细胞或RNAseq)参考数据集,它将基于与参考数据的相似性标记测试数据集中的新细胞...
整合-HBC lesson 6.2
本文主要是翻译,用作参考,还是要看GitHub上的英文原版学习 目标 对于不同条件下的样本,将相同类型的细胞对齐到一起 挑战 对准类似的细胞类型,这样我们就不会因为样品、条件、模式或批次的不...
windows R 内存管理
在做单细胞数据分析的时候习惯生成和保存很多中间变量,以便于debug的时候方便直接读取某一个中间变量进行后续分析。这些变量包括很多seurat object,对于多样本整合的数据来讲最后会很大,每次...
激光扫描共聚焦显微镜和超高分辨率显微镜
分子标记物:荧光素 Fluophore 能够吸收能量并在释放能量的过程中发光,吸收短波长的能量后发射出长波长的光。当激发照射停止,发射光也消失 。荧光素都需要知道2个波长: 激发光波长(excitati...
linux添加环境变量
"Linux笔记" ubuntu 在用户主目录下有一个 .bashrc 隐藏文件,可以在此文件中加入 PATH 的设置如下: sudo vim ~/.bashrc 加入: export PATH=<你的要加入的路径>:$PATH e...






















啦噜噜1年前0
发现宝藏miaomiaomiao3年前0
回顾一下LBL3年前0
不错👍KT3年前0
汝甚秀,吾不及汝LBL3年前0
太强了 优秀KT3年前0
确实xmq3年前0
太棒了,之前用的等候回答卡的要死,还动不动显示error,这个真的反应很快!xmq3年前0
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