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QC(质控)-HBC lesson 4-香草杏仁

QC(质控)-HBC lesson 4

QC(质控)-HBC lesson 4 在这一章你将会学到: 构建质控指标并使用相关图像可视化数据质量 估算质控指标并设置阈值去除低质量的细胞 单细胞数据分析流程的每个步骤都有这自己的目标和挑战。对...
Seurat基本分析流程-香草杏仁

Seurat基本分析流程

参考链接: https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial.html 建立 Seurat 对象 示例数据为10X Genomics的外周血单个核细胞(PBMC)数据集,含有2700个单细胞,使用Illumina NextSeq...
Sortilin enhances fibrosis and calcification in aortic valve disease by inducing interstitial cell heterogeneity-香草杏仁

Sortilin enhances fibrosis and calcification in aortic valve disease by inducing interstitial cell heterogeneity

​​ 主要研究结果 SORT1与AS的遗传关联 ​​ 对SORT1基因组50kb范围的555个变体进行meta分析: 11个变体与AS显著相关,但可能仅包含一个独立的信号 ​​ sortlin缺失减弱主动脉瓣狭窄的发展并...
ATVB:主动脉瓣狭窄的性别差异蛋白质组学-香草杏仁

ATVB:主动脉瓣狭窄的性别差异蛋白质组学

本文研究了钙化性主动脉瓣狭窄(AS)中血浆和组织蛋白质组的性别差异。通过LC-MS/ms技术,分析了32名男性和20名女性的血浆样本,发现20种循环蛋白在两性之间存在显著差异。男性的富集蛋白与急性...
linux添加环境变量-香草杏仁

linux添加环境变量

"Linux笔记" ubuntu ​​ 在用户主目录下有一个 .bashrc 隐藏文件,可以在此文件中加入 PATH 的设置如下: sudo vim ~/.bashrc 加入: export PATH=<你的要加入的路径>:$PATH e...
cellranger的安装-香草杏仁

cellranger的安装

新建一个文件夹 打开linux终端,运行 mkdir yard 验证一下工作目录 pwd /home/vamond/yard 进入该目录,新建apps文件夹,用于存放cellreanger cd /mnt/home/user.name/yard mkdir apps cd apps ...
Circulation:重激活氧化的sGC作为减缓AVS进展的新治疗策略-香草杏仁

Circulation:重激活氧化的sGC作为减缓AVS进展的新治疗策略

本研究探讨了通过重新激活氧化状态下的可溶性鸟苷酸环化酶(sGC)作为一种减缓钙化性主动脉瓣狭窄(FCAVS)进展的新治疗策略。FCAVS是一种常见于老年人的心血管疾病,现有药物治疗效果有限,目...
细胞聚类的质控-HBC lesson 8-香草杏仁

细胞聚类的质控-HBC lesson 8

学习内容 评估是否存在聚类的假象 用PCA和UMAP图来确定聚类的质量,并了解何时需要重新聚类 评估已知的细胞类型标志物以假设集群的细胞类型身份 目标 确定集群是否代表真正的细胞类型或由于生物...
细胞工程-香草杏仁

细胞工程

核酸导入技术 将特异的核酸(DNA或RNA)导入到真核细胞中 ,以研究蛋白特性、调控基因表达、调节细胞行为等 常用的核酸导入方法 化学方法:构建非病毒载体(脂质体、DEAE-葡聚糖法、磷酸钙法导入...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond4年前
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