使用singleR预测细胞类型-香草杏仁

使用singleR预测细胞类型

SingleR是用于单细胞RNA测序(scRNAseq)数据的自动注释方法(Aran et al.2019)。给定具有已知标签的样本(单细胞或RNAseq)参考数据集,它将基于与参考数据的相似性标记测试数据集中的新细胞...
MJ绘画基础教程--part1 🎨文生图的创作流程参考-香草杏仁

MJ绘画基础教程–part1 🎨文生图的创作流程参考

本文介绍了使用文生图进行绘画的流程,包括输入描述词、选择AI模型、设置尺寸、添加参考图、选择参数等步骤。同时提到了混合图片的方法和咒语解析过程,全面指导新手如何利用文生图进行创作。
Vamond的头像-香草杏仁Vamond2年前
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NC文章:FCAVD的性别特异性脂质组学特征-香草杏仁

NC文章:FCAVD的性别特异性脂质组学特征

 题目:Sex-specific lipidomic signatures in aortic valve disease reflect differential fibro-calcific progression期刊:Nature Communications(2025)DOI:10.1038/s41467-025-60411-2...
linux常用命令:tar-香草杏仁

linux常用命令:tar

​​ Linux tar(英文全拼:tape archive )命令用于备份文件。 ​tar​是用来建立,还原备份文件的工具程序,它可以加入,解开备份文件内的文件。 备份文件不完全等同于压缩文件,linux中的备...
Seurat基本分析流程-香草杏仁

Seurat基本分析流程

参考链接: https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial.html 建立 Seurat 对象 示例数据为10X Genomics的外周血单个核细胞(PBMC)数据集,含有2700个单细胞,使用Illumina NextSeq...
安装omicverse docker版-香草杏仁

安装omicverse docker版

本文介绍了如何在Linux系统上安装Omicverse的Docker版本。Omicverse是一个基于Python的高通量测序数据分析框架,具有统一输入输出和改进的可视化功能。作者首先尝试通过conda和pip方式安装,但...
单细胞聚类resolution参数的选择-香草杏仁

单细胞聚类resolution参数的选择

在进行细胞聚类时有两个参数的选择对下游分析的结果影响很大 一个是纳入分析的PCs数,也就是dims参数,选择方法见 关于“数据的维度”(dims参数)的选择 ; 另一个是resolution参数,官方推荐根...
关于“数据的维度”(dims参数)的选择-香草杏仁

关于“数据的维度”(dims参数)的选择

关于“数据的维度”(dims参数)的选择 Created time: Apr 13, 2021 12:07 PM Tags: R, Seurat, scRNA-seq 完成PCA之后,我们获得了该数据集的所有主成分(PCs)信息,但是如何决定纳入多少个主成...
离心分离技术-香草杏仁

离心分离技术

离心分离技术 离心技术的基本概念 利用溶液中颗粒密度、大小等特性,用旋转产生的离心力使不同特性颗粒在溶液中分离并沉降,从而达到分离、浓缩、 提纯的目的,称为离心技术。 离心分离三要素:...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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ChatGPT香草杏仁版-香草杏仁

ChatGPT香草杏仁版

2023. 3. 24 更新!最新版本的ChatGPT已经更新,重新部署并选择了轻量版以提高性能。基于github开源项目,免费使用,无需科学上网。加入密钥验证以避免滥用,仅限本站访客使用。使用API时可选择...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond3年前
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