核酸导入技术 将特异的核酸(DNA或RNA)导入到真核细胞中 ，以研究蛋白特性、调控基因表达、调节细胞行为等 常用的核酸导入方法 化学方法：构建非病毒载体（脂质体、DEAE-葡聚糖法、磷酸钙法导入...

因为课题研究需要结合参考一篇已发表的单细胞数据，由于该文章只提供的原始fastq文件，所有要下载下来从上游分析开始做起。（如果是是做数据库生信挖掘的也需要下载文件哦）一开始尝试的使用htt...

经验证，人类样本的单细胞分析使用seurat教程的方法计算线粒体序列比例与此方法结果一致，但对于其他物种，建议使用此方法。 使用注释文件生成线粒体计数指标 我们将使用AnnotationHub，它允许...

该研究整合胎儿、健康参照和钙化主动脉瓣单细胞图谱，并结合GWAS、bulk RNA-seq及体外功能实验，发现CAVD中炎症相关VDSC1和VDSC3显著扩增，遗传与疾病转录信号共同定位于VDSC，并筛出INHBA。敲...

参考链接: https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial.html 建立 Seurat 对象 示例数据为10X Genomics的外周血单个核细胞（PBMC）数据集，含有2700个单细胞，使用Illumina NextSeq...

流式细胞术（Flow Cytometry，FCM，FACS）是以流式细胞仪为检测手段的一项能快速、精确的对单个细胞(或生物学颗粒)的理化特性进行多参数定量分析和分选的技术。 流式细胞仪的结构和原理 分析型...

本文介绍了如何通过Aspera工具批量下载EBI数据库中的fastq或sra文件。首先，用户需通过conda创建一个新的环境并安装Aspera CLI和sra-tools。在获取到目标文件的下载链接后，可以使用Aspera命令...

本文介绍了如何在Linux系统上安装Omicverse的Docker版本。Omicverse是一个基于Python的高通量测序数据分析框架，具有统一输入输出和改进的可视化功能。作者首先尝试通过conda和pip方式安装，但...

新建一个文件夹 打开linux终端，运行 mkdir yard 验证一下工作目录 pwd /home/vamond/yard 进入该目录，新建apps文件夹，用于存放cellreanger cd /mnt/home/user.name/yard mkdir apps cd apps ...