本文介绍了如何在Linux系统上安装Omicverse的Docker版本。Omicverse是一个基于Python的高通量测序数据分析框架，具有统一输入输出和改进的可视化功能。作者首先尝试通过conda和pip方式安装，但...

​​ conda的下载与安装 创建小环境并在其内安装软件 创建名为rna-seq​的小环境 # conda create -n [名称]，后面是要安装的主要软件 conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y ...

本研究致力于探讨主动脉瓣功能及其与主动脉瓣狭窄（AS）风险相关的遗传变异。通过对UK Biobank中62902名参与者进行相差心血管磁共振成像（cMRI），结合深度学习技术，自动提取了三项关键的生理...

Maturation of heart valve cell populations during postnatal remodeling Article type: Original Article Institute: The Heart Institute, Division of Molecular Cardiovascular Biology, ...

学习内容 学会选择合适的PCs用于聚类分析 聚类的方法 目标 产生细胞类型特异性聚类，并使用已知的细胞类型标记基因来确定聚类的身份。 确定集群是否代表真正的细胞类型或由于生物或技术差异而产...

2023. 3. 24 更新！最新版本的ChatGPT已经更新，重新部署并选择了轻量版以提高性能。基于github开源项目，免费使用，无需科学上网。加入密钥验证以避免滥用，仅限本站访客使用。使用API时可选择...

本文详细记录了在Linux系统上安装COMPASS软件的过程，COMPASS是一款用于单细胞转录组代谢流分析的软件。首先，需要创建一个Python 3.9或3.10的conda环境，并确保pandas版本低于2.0.0。接着，安...

本文探讨了鞘氨醇-1-磷酸（S1P）信号通路在主动脉瓣疾病（AVD）进展中的作用。研究显示，随着人口老龄化，AVD 在老年人群中日益普遍，现有的治疗手段主要限于瓣膜置换，缺乏有效的药物干预。本...

基本技术 细胞的分离和原代培养 猪VICs的分离培养（以我自己使用的原代细胞为例） 将4-6月龄的猪使用丙泊酚诱导麻醉后，静脉注射氯化钾处死； 开胸后分离结扎主动脉、上腔静脉、下腔静脉，摘除...

本研究通过靶向PAR2的磁性纳米颗粒，实现了针对主动脉瓣钙化的靶向药物递送系统。研究发现PAR2在成骨细胞中高表达，并促进瓣膜钙化，针对PAR2阳性细胞的干预可抑制瓣膜钙化的发展。利用功能化的...