基本技术 细胞的分离和原代培养 猪VICs的分离培养（以我自己使用的原代细胞为例） 将4-6月龄的猪使用丙泊酚诱导麻醉后，静脉注射氯化钾处死； 开胸后分离结扎主动脉、上腔静脉、下腔静脉，摘除...

本研究通过多组学映射生成主动脉瓣的分子图谱，揭示了驱动钙化性主动脉瓣病（CAVD）疾病的网络。研究将瓣膜组织分为正常、纤维化和钙化三个区，分析组学数据并进行免疫荧光验证，发现转录组与蛋...

本研究探讨了主动脉瓣钙化的机制以及潜在的预防策略。研究发现，ALDH1A1基因在钙化的主动脉瓣膜中显著下调，其缺失可能促使瓣膜间质细胞向成骨样表型转变，从而加速钙化进程。此外，TGF-β1通过...

学习内容 评估是否存在聚类的假象 用PCA和UMAP图来确定聚类的质量，并了解何时需要重新聚类 评估已知的细胞类型标志物以假设集群的细胞类型身份 目标 确定集群是否代表真正的细胞类型或由于生物...

QC（质控）-HBC lesson 4 在这一章你将会学到： 构建质控指标并使用相关图像可视化数据质量 估算质控指标并设置阈值去除低质量的细胞 单细胞数据分析流程的每个步骤都有这自己的目标和挑战。对...

本文详细记录了在Linux系统上安装COMPASS软件的过程，COMPASS是一款用于单细胞转录组代谢流分析的软件。首先，需要创建一个Python 3.9或3.10的conda环境，并确保pandas版本低于2.0.0。接着，安...

​​ ​.rds​和.Rdata​ （也称为.rda​ ）文件都可用于以R本机格式存储R对象。与非本机存储方法（例如write.table相比，保存此方法有多个优点： 1)将数据恢复到R更快 2)它保持在数据中编码的R...

本研究探讨了Lumican（LUM）在钙化主动脉瓣病（CAVD）中的作用。通过单细胞RNA测序分析发现，LUM在VICs的转变中发挥关键作用，并促进H3组蛋白乳酸化，进而加速钙化过程。去除LUM可改善钙化情况...

本文探讨了鞘氨醇-1-磷酸（S1P）信号通路在主动脉瓣疾病（AVD）进展中的作用。研究显示，随着人口老龄化，AVD 在老年人群中日益普遍，现有的治疗手段主要限于瓣膜置换，缺乏有效的药物干预。本...