单细胞转录组代谢流分析软件COMPASS&MEBOCOST安装-香草杏仁

单细胞转录组代谢流分析软件COMPASS&MEBOCOST安装

本文详细记录了在Linux系统上安装COMPASS软件的过程,COMPASS是一款用于单细胞转录组代谢流分析的软件。首先,需要创建一个Python 3.9或3.10的conda环境,并确保pandas版本低于2.0.0。接着,安...
scRNA-seq简介-HBC lesson 1-香草杏仁

scRNA-seq简介-HBC lesson 1

参考链接: https://github.com/hbctraining/scRNA-seq_online/blob/master/lessons/01_intro_to_scRNA-seq.md 我们为什么需要单细胞RNA测序 人类各种组织之间细胞的类型,状态和相互作用差异巨...
本地部署Deepseek-R1+知识库构建-香草杏仁

本地部署Deepseek-R1+知识库构建

本文介绍了在本地部署Deepseek-R1模型并构建知识库的步骤,主要分为五个部分。首先,用户需要安装Ollama软件,并通过命令行下载所需的模型。接着,通过访问指定的本地端口,可以在浏览器中查看...
Circulation:主动脉瓣钙化是由ALDH1A1的丧失引起的,并且可以通过视黄酸受体α的激动剂来预防-香草杏仁

Circulation:主动脉瓣钙化是由ALDH1A1的丧失引起的,并且可以通过视黄酸受体α的激动剂来预防

本研究探讨了主动脉瓣钙化的机制以及潜在的预防策略。研究发现,ALDH1A1基因在钙化的主动脉瓣膜中显著下调,其缺失可能促使瓣膜间质细胞向成骨样表型转变,从而加速钙化进程。此外,TGF-β1通过...
ATVB:多组学揭示CAVD基质细胞状态变化与INHBA相关重塑-香草杏仁

ATVB:多组学揭示CAVD基质细胞状态变化与INHBA相关重塑

该研究整合胎儿、健康参照和钙化主动脉瓣单细胞图谱,并结合GWAS、bulk RNA-seq及体外功能实验,发现CAVD中炎症相关VDSC1和VDSC3显著扩增,遗传与疾病转录信号共同定位于VDSC,并筛出INHBA。敲...
EHJ:Lumican通过H3组蛋白乳酸化促进CAVD-香草杏仁

EHJ:Lumican通过H3组蛋白乳酸化促进CAVD

本研究探讨了Lumican(LUM)在钙化主动脉瓣病(CAVD)中的作用。通过单细胞RNA测序分析发现,LUM在VICs的转变中发挥关键作用,并促进H3组蛋白乳酸化,进而加速钙化过程。去除LUM可改善钙化情况...
Nature Genetics:主动脉瓣功能及主动脉瓣狭窄风险相关遗传变异的多性状分析研究-香草杏仁

Nature Genetics:主动脉瓣功能及主动脉瓣狭窄风险相关遗传变异的多性状分析研究

本研究致力于探讨主动脉瓣功能及其与主动脉瓣狭窄(AS)风险相关的遗传变异。通过对UK Biobank中62902名参与者进行相差心血管磁共振成像(cMRI),结合深度学习技术,自动提取了三项关键的生理...
Circulation:二叶式主动脉瓣的基因组与转录组学研究-香草杏仁

Circulation:二叶式主动脉瓣的基因组与转录组学研究

本研究旨在探讨二叶式主动脉瓣(BAV)的基因组和转录组学特征,以揭示其遗传机制。BAV 是一种常见的先天性心脏缺陷,尽管其遗传性较强,但目前已知的单基因突变仅能解释部分病例。为了解决这一...
CVR:FOXS1介导胆固醇转运失调驱动主动脉瓣钙化研究-香草杏仁

CVR:FOXS1介导胆固醇转运失调驱动主动脉瓣钙化研究

本研究探讨了氧化低密度脂蛋白(oxLDL)诱导的转录因子FOXS1在钙化性主动脉瓣疾病(CAVD)中的作用。研究表明,oxLDL通过激活FOXS1导致胆固醇转运功能障碍,从而引发瓣膜间质细胞(VICs)的成骨...
ATVB:主动脉瓣狭窄的性别差异蛋白质组学-香草杏仁

ATVB:主动脉瓣狭窄的性别差异蛋白质组学

本文研究了钙化性主动脉瓣狭窄(AS)中血浆和组织蛋白质组的性别差异。通过LC-MS/ms技术,分析了32名男性和20名女性的血浆样本,发现20种循环蛋白在两性之间存在显著差异。男性的富集蛋白与急性...