关于“数据的维度”(dims参数)的选择 Created time: Apr 13, 2021 12:07 PM Tags: R, Seurat, scRNA-seq 完成PCA之后，我们获得了该数据集的所有主成分（PCs）信息，但是如何决定纳入多少个主成...

Zhou, Li, Jun-Yi Li, Ping-Ping He, Xiao-Hua Yu, and Chao-Ke Tang. “Resistin: Potential Biomarker and Therapeutic Target in Atherosclerosis.” Clinica Chimica Acta; International J...

​​ conda的下载与安装 创建小环境并在其内安装软件 创建名为rna-seq​的小环境 # conda create -n [名称]，后面是要安装的主要软件 conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y ...

Midkine Prevents Calcification of Aortic Valve Interstitial Cells via Intercellular Crosstalk. Zhou Q, Cao H, Hang X, Liang H, Zhu M, Fan Y, Shi J, Dong N, He X. Midkine Prevents C...

在进行细胞聚类时有两个参数的选择对下游分析的结果影响很大 一个是纳入分析的PCs数，也就是dims参数，选择方法见 关于“数据的维度”(dims参数)的选择 ； 另一个是resolution参数，官方推荐根...

新建一个文件夹 打开linux终端，运行 mkdir yard 验证一下工作目录 pwd /home/vamond/yard 进入该目录，新建apps文件夹，用于存放cellreanger cd /mnt/home/user.name/yard mkdir apps cd apps ...

QC（质控）-HBC lesson 4 在这一章你将会学到： 构建质控指标并使用相关图像可视化数据质量 估算质控指标并设置阈值去除低质量的细胞 单细胞数据分析流程的每个步骤都有这自己的目标和挑战。对...

这篇文本介绍了一款强大的提示词生成工具的功能特色，包括分类完善、热门提示词展示、多语言支持、便捷操作、定期更新和开箱即用等。点击下方按钮可直接使用！

因为课题研究需要结合参考一篇已发表的单细胞数据，由于该文章只提供的原始fastq文件，所有要下载下来从上游分析开始做起。（如果是是做数据库生信挖掘的也需要下载文件哦）一开始尝试的使用htt...