最近由于CPU、内存等降价明显，自己配了一台洋垃圾，双路E5-2696V3, 36核72线程+128G内存，用来学习linux系统和生信分析，自己用目前是足够了，后续如果需求提高了可以升级到256G内存，目前一套...

Zhou, Li, Jun-Yi Li, Ping-Ping He, Xiao-Hua Yu, and Chao-Ke Tang. “Resistin: Potential Biomarker and Therapeutic Target in Atherosclerosis.” Clinica Chimica Acta; International J...

​​ ​.rds​和.Rdata​ （也称为.rda​ ）文件都可用于以R本机格式存储R对象。与非本机存储方法（例如write.table相比，保存此方法有多个优点： 1)将数据恢复到R更快 2)它保持在数据中编码的R...

本文介绍了如何通过Aspera工具批量下载EBI数据库中的fastq或sra文件。首先，用户需通过conda创建一个新的环境并安装Aspera CLI和sra-tools。在获取到目标文件的下载链接后，可以使用Aspera命令...

本研究致力于探讨主动脉瓣功能及其与主动脉瓣狭窄（AS）风险相关的遗传变异。通过对UK Biobank中62902名参与者进行相差心血管磁共振成像（cMRI），结合深度学习技术，自动提取了三项关键的生理...

SingleR是用于单细胞RNA测序（scRNAseq）数据的自动注释方法（Aran et al.2019）。给定具有已知标签的样本（单细胞或RNAseq）参考数据集，它将基于与参考数据的相似性标记测试数据集中的新细胞...

Yin 等结合人主动脉瓣基质蛋白质组、糖蛋白组、细胞实验及遗传小鼠模型，揭示非钙化区与钙化区的 VCAN/ACAN 组成差异，以及 ADAMTS5 活性缺失背景下的蛋白聚糖积聚和瓣膜功能障碍。本文逐图梳理...

前言 最近在学习单细胞转录组的上游分析，不得已安装了ubuntu18.04系统，第一次使用linux，怪不习惯的，而且很多在win10平台下很方便的功能在linux下找到替代会稍微费点精力。 比如我习惯后台跑...

本文研究了钙化性主动脉瓣狭窄（AS）中血浆和组织蛋白质组的性别差异。通过LC-MS/ms技术，分析了32名男性和20名女性的血浆样本，发现20种循环蛋白在两性之间存在显著差异。男性的富集蛋白与急性...