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scRNA-seq简介-HBC lesson 1
参考链接: https://github.com/hbctraining/scRNA-seq_online/blob/master/lessons/01_intro_to_scRNA-seq.md 我们为什么需要单细胞RNA测序 人类各种组织之间细胞的类型,状态和相互作用差异巨...
linux常用命令: systemctl
linux系统结构/lib/systemd/system目录 根据 Linux 惯例,字母d是守护进程(daemon)的缩写。 Systemd 这个名字的含义,就是它要守护整个系统。 该目录自动存放启动文件的配置位置,里...
Resistin: Potential biomarker and therapeutic target in atherosclerosis
Zhou, Li, Jun-Yi Li, Ping-Ping He, Xiao-Hua Yu, and Chao-Ke Tang. “Resistin: Potential Biomarker and Therapeutic Target in Atherosclerosis.” Clinica Chimica Acta; International J...
通过注释文件计算线粒体序列比例
经验证,人类样本的单细胞分析使用seurat教程的方法计算线粒体序列比例与此方法结果一致,但对于其他物种,建议使用此方法。 使用注释文件生成线粒体计数指标 我们将使用AnnotationHub,它允许...
“归一化”与“标准化”
参考链接: https://mp.weixin.qq.com/s/6ioR3JE0wKg6M-YAsLBcTA 关于归一化和标准化的翻译看了很多中文资料,发现还是有争议的,在seurat中主要是两个函数:NormalizeData()和ScaleData() ,其...
细胞生物学技术考前参考
核心重点(非官方) 选择题 高严格度条件 不同离心方法的适用性 沉降系数、离心力与什么因素有关? 转录因子重编程 检测细胞增殖或凋亡的手段及检测方法 流式的几个对照组 名词解释 透射电子与...
支持linux平台的截图神器flameshot
前言 最近在学习单细胞转录组的上游分析,不得已安装了ubuntu18.04系统,第一次使用linux,怪不习惯的,而且很多在win10平台下很方便的功能在linux下找到替代会稍微费点精力。 比如我习惯后台跑...
cellranger的安装
新建一个文件夹 打开linux终端,运行 mkdir yard 验证一下工作目录 pwd /home/vamond/yard 进入该目录,新建apps文件夹,用于存放cellreanger cd /mnt/home/user.name/yard mkdir apps cd apps ...
ATVB:主动脉瓣狭窄的性别差异蛋白质组学
本文研究了钙化性主动脉瓣狭窄(AS)中血浆和组织蛋白质组的性别差异。通过LC-MS/ms技术,分析了32名男性和20名女性的血浆样本,发现20种循环蛋白在两性之间存在显著差异。男性的富集蛋白与急性...
下载sra文件(多线程高速版) download_sra.sh
这篇文章介绍了一个多线程下载NCBI数据库中SRA文件的脚本download_sra.sh。使用前需要确认已安装sra-tools。该脚本通过prefetch命令,可以高效地下载各种SRA文件,包括bulk-seq和single cell原...













啦噜噜1年前0
发现宝藏miaomiaomiao3年前0
回顾一下LBL3年前0
不错👍KT3年前0
汝甚秀,吾不及汝LBL3年前0
太强了 优秀KT3年前0
确实xmq3年前0
太棒了,之前用的等候回答卡的要死,还动不动显示error,这个真的反应很快!xmq3年前0
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