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聚类分析-HBC lesson 7-香草杏仁

聚类分析-HBC lesson 7

学习内容 学会选择合适的PCs用于聚类分析 聚类的方法 目标 产生细胞类型特异性聚类,并使用已知的细胞类型标记基因来确定聚类的身份。 确定集群是否代表真正的细胞类型或由于生物或技术差异而产...
细胞培养基及添加剂的一些知识-香草杏仁

细胞培养基及添加剂的一些知识

培养基的基本成分 血清 血清是白蛋白、生长因子和生长抑制剂的复杂混合物,可能是细胞培养基中最重要的成分之一。最常用的血清是胎牛血清(FBS)。其他可用的血清类型包括新生小牛血清和马血清...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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scRNA-seq数据整合Introduction-香草杏仁

scRNA-seq数据整合Introduction

Seurat不仅可以校正实验的批次效应,还能跨平台整合数据,例如将10x单细胞数据、BD单细胞数据和SMART单细胞数据整合在一起;也能整合单细胞多组学数据,例如将单细胞ATAC、空间转录组与单细胞转...
EHJ:活化的血小板促进成骨并推动钙化性主动脉瓣狭窄的进展-香草杏仁

EHJ:活化的血小板促进成骨并推动钙化性主动脉瓣狭窄的进展

本研究探讨了活化血小板对钙化性主动脉瓣狭窄(CAVS)进展的影响。结果显示,活化血小板通过分泌ADP促进心脏瓣膜间质细胞(VICs)的成骨程序,进一步导致钙化。研究利用多种技术(如SEM、免疫荧...
ubuntu 设置自动挂载磁盘-香草杏仁

ubuntu 设置自动挂载磁盘

系统:ubuntu20.04 创建挂载目录 sudo mkdir /mnt/data 磁盘查看磁盘信息 # 列出磁盘 lsblk # 查看磁盘UUID sudo blkid ### 输出中找到自己想挂载的磁盘,比如下面这个 ### /dev/sda1: LABEL='d...
归一化并去除不需要的变异-HBC lesson 6.1-香草杏仁

归一化并去除不需要的变异-HBC lesson 6.1

在我们可以聚类细胞并识别不同的潜在细胞类型之前,我们还有几个步骤。我们的数据集有两个样本来自两个不同的条件(控制和刺激),所以整合这些样本,以更好地进行比较可能是有帮助的。我们需要...
Giving Calcification Its Due: Recognition of a Diverse Disease: A First Attempt to Standardize the Field-香草杏仁

Giving Calcification Its Due: Recognition of a Diverse Disease: A First Attempt to Standardize the Field

Giving Calcification Its Due: Recognition of a Diverse Disease: A First Attempt to Standardize the Field Article type: Review Files: CIRCRESAHA.116.310060.pdf Publication Year: 201...
生信分析环境配置:conda-香草杏仁

生信分析环境配置:conda

最近由于CPU、内存等降价明显,自己配了一台洋垃圾,双路E5-2696V3, 36核72线程+128G内存,用来学习linux系统和生信分析,自己用目前是足够了,后续如果需求提高了可以升级到256G内存,目前一套...
Circulation:动脉钙化与瓣膜钙化的EVs多组学揭示特异调控因子-香草杏仁

Circulation:动脉钙化与瓣膜钙化的EVs多组学揭示特异调控因子

通过全组织蛋白质组学和组织EV囊泡组学,研究发现动脉钙化和瓣膜钙化具有不同的驱动因素。进一步分析揭示了颈动脉斑块和AV钙化组织中的关键蛋白,涉及细胞粘附、迁移、炎症、补体级联反应等途径...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond2年前
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