核酸导入技术 将特异的核酸(DNA或RNA)导入到真核细胞中 ，以研究蛋白特性、调控基因表达、调节细胞行为等 常用的核酸导入方法 化学方法：构建非病毒载体（脂质体、DEAE-葡聚糖法、磷酸钙法导入...

​​ 主要研究结果 SORT1与AS的遗传关联 ​​ 对SORT1基因组50kb范围的555个变体进行meta分析： 11个变体与AS显著相关，但可能仅包含一个独立的信号 ​​ sortlin缺失减弱主动脉瓣狭窄的发展并...

​​ conda的下载与安装 创建小环境并在其内安装软件 创建名为rna-seq​的小环境 # conda create -n [名称]，后面是要安装的主要软件 conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y ...

根据所使用的建库方法，单细胞的RNA序列（也称为读取（reads）或标签（tags））将从转录本的3'端（或5'端）（10X Genomics，CEL-seq2，Drop-seq，inDrops）或全长转录本（Smart-seq）获得。 参...

关于“数据的维度”(dims参数)的选择 Created time: Apr 13, 2021 12:07 PM Tags: R, Seurat, scRNA-seq 完成PCA之后，我们获得了该数据集的所有主成分（PCs）信息，但是如何决定纳入多少个主成...

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QC（质控）-HBC lesson 4 在这一章你将会学到： 构建质控指标并使用相关图像可视化数据质量 估算质控指标并设置阈值去除低质量的细胞 单细胞数据分析流程的每个步骤都有这自己的目标和挑战。对...

​​ Linux tar（英文全拼：tape archive ）命令用于备份文件。 ​tar​是用来建立，还原备份文件的工具程序，它可以加入，解开备份文件内的文件。 备份文件不完全等同于压缩文件，linux中的备...

这篇文章介绍了一个多线程下载NCBI数据库中SRA文件的脚本download_sra.sh。使用前需要确认已安装sra-tools。该脚本通过prefetch命令，可以高效地下载各种SRA文件，包括bulk-seq和single cell原...

该研究整合胎儿、健康参照和钙化主动脉瓣单细胞图谱，并结合GWAS、bulk RNA-seq及体外功能实验，发现CAVD中炎症相关VDSC1和VDSC3显著扩增，遗传与疾病转录信号共同定位于VDSC，并筛出INHBA。敲...