本文详细记录了在Linux系统上安装COMPASS软件的过程，COMPASS是一款用于单细胞转录组代谢流分析的软件。首先，需要创建一个Python 3.9或3.10的conda环境，并确保pandas版本低于2.0.0。接着，安...

离心分离技术 离心技术的基本概念 利用溶液中颗粒密度、大小等特性，用旋转产生的离心力使不同特性颗粒在溶液中分离并沉降，从而达到分离、浓缩、 提纯的目的，称为离心技术。 离心分离三要素：...

本研究通过多组学映射生成主动脉瓣的分子图谱，揭示了驱动钙化性主动脉瓣病（CAVD）疾病的网络。研究将瓣膜组织分为正常、纤维化和钙化三个区，分析组学数据并进行免疫荧光验证，发现转录组与蛋...

学习内容 学会选择合适的PCs用于聚类分析 聚类的方法 目标 产生细胞类型特异性聚类，并使用已知的细胞类型标记基因来确定聚类的身份。 确定集群是否代表真正的细胞类型或由于生物或技术差异而产...

在进行细胞聚类时有两个参数的选择对下游分析的结果影响很大 一个是纳入分析的PCs数，也就是dims参数，选择方法见 关于“数据的维度”(dims参数)的选择 ； 另一个是resolution参数，官方推荐根...

酵母双杂交（yeast two-hybrid） 酵母双杂交系统是在真核模式生物酵母中进行的，研究活细胞内蛋白质相互作用，是一种具有很高灵敏度的研究蛋白质之间关系的技术。 当我们将已知基因编码的蛋白作...

因为课题研究需要结合参考一篇已发表的单细胞数据，由于该文章只提供的原始fastq文件，所有要下载下来从上游分析开始做起。（如果是是做数据库生信挖掘的也需要下载文件哦）一开始尝试的使用htt...

 题目：Sex-specific lipidomic signatures in aortic valve disease reflect differential fibro-calcific progression期刊：Nature Communications（2025）DOI：10.1038/s41467-025-60411-2...

通过全组织蛋白质组学和组织EV囊泡组学，研究发现动脉钙化和瓣膜钙化具有不同的驱动因素。进一步分析揭示了颈动脉斑块和AV钙化组织中的关键蛋白，涉及细胞粘附、迁移、炎症、补体级联反应等途径...