本文详细记录了在Linux系统上安装COMPASS软件的过程，COMPASS是一款用于单细胞转录组代谢流分析的软件。首先，需要创建一个Python 3.9或3.10的conda环境，并确保pandas版本低于2.0.0。接着，安...

参考链接: https://github.com/hbctraining/scRNA-seq_online/blob/master/lessons/01_intro_to_scRNA-seq.md 我们为什么需要单细胞RNA测序 人类各种组织之间细胞的类型，状态和相互作用差异巨...

本文介绍了在本地部署Deepseek-R1模型并构建知识库的步骤，主要分为五个部分。首先，用户需要安装Ollama软件，并通过命令行下载所需的模型。接着，通过访问指定的本地端口，可以在浏览器中查看...

本研究探讨了主动脉瓣钙化的机制以及潜在的预防策略。研究发现，ALDH1A1基因在钙化的主动脉瓣膜中显著下调，其缺失可能促使瓣膜间质细胞向成骨样表型转变，从而加速钙化进程。此外，TGF-β1通过...

本文介绍了如何通过Aspera工具批量下载EBI数据库中的fastq或sra文件。首先，用户需通过conda创建一个新的环境并安装Aspera CLI和sra-tools。在获取到目标文件的下载链接后，可以使用Aspera命令...

该研究整合人主动脉瓣组织学、单细胞RNA测序、Visium空间转录组及RNA-FISH，描绘CAVD中VIC与巨噬细胞的性别偏倚状态。男性组织呈更高钙化负荷并有COMP阳性细胞靠近钙化灶，女性组织SERPINE1阳性...

该研究结合终末期人主动脉瓣 bulk RNA-seq、Kawamoto 未脱钙组织学、micro-CT 与独立 TAVI 队列，比较二叶式和三叶式主动脉瓣狭窄。bAVS 呈现更广泛的血管生成、炎症和基质重塑相关转录改变，并...

该研究整合胎儿、健康参照和钙化主动脉瓣单细胞图谱，并结合GWAS、bulk RNA-seq及体外功能实验，发现CAVD中炎症相关VDSC1和VDSC3显著扩增，遗传与疾病转录信号共同定位于VDSC，并筛出INHBA。敲...

本研究致力于探讨主动脉瓣功能及其与主动脉瓣狭窄（AS）风险相关的遗传变异。通过对UK Biobank中62902名参与者进行相差心血管磁共振成像（cMRI），结合深度学习技术，自动提取了三项关键的生理...

本研究旨在探讨二叶式主动脉瓣（BAV）的基因组和转录组学特征，以揭示其遗传机制。BAV 是一种常见的先天性心脏缺陷，尽管其遗传性较强，但目前已知的单基因突变仅能解释部分病例。为了解决这一...