本文介绍了如何通过Aspera工具批量下载EBI数据库中的fastq或sra文件。首先，用户需通过conda创建一个新的环境并安装Aspera CLI和sra-tools。在获取到目标文件的下载链接后，可以使用Aspera命令...

本研究探讨了活化血小板对钙化性主动脉瓣狭窄（CAVS）进展的影响。结果显示，活化血小板通过分泌ADP促进心脏瓣膜间质细胞（VICs）的成骨程序，进一步导致钙化。研究利用多种技术（如SEM、免疫荧...

本文探讨了鞘氨醇-1-磷酸（S1P）信号通路在主动脉瓣疾病（AVD）进展中的作用。研究显示，随着人口老龄化，AVD 在老年人群中日益普遍，现有的治疗手段主要限于瓣膜置换，缺乏有效的药物干预。本...

Harmony方法在2019年发表在上面nature methods， harmony算法与其他整合算法相比的优势： 整合数据的同时对稀有细胞的敏感性依然很好； 省内存； 适合于更复杂的单细胞分析实验设计，可以比较来...

酵母双杂交（yeast two-hybrid） 酵母双杂交系统是在真核模式生物酵母中进行的，研究活细胞内蛋白质相互作用，是一种具有很高灵敏度的研究蛋白质之间关系的技术。 当我们将已知基因编码的蛋白作...

根据所使用的建库方法，单细胞的RNA序列（也称为读取（reads）或标签（tags））将从转录本的3'端（或5'端）（10X Genomics，CEL-seq2，Drop-seq，inDrops）或全长转录本（Smart-seq）获得。 参...

前言 最近在学习单细胞转录组的上游分析，不得已安装了ubuntu18.04系统，第一次使用linux，怪不习惯的，而且很多在win10平台下很方便的功能在linux下找到替代会稍微费点精力。 比如我习惯后台跑...

最近由于CPU、内存等降价明显，自己配了一台洋垃圾，双路E5-2696V3, 36核72线程+128G内存，用来学习linux系统和生信分析，自己用目前是足够了，后续如果需求提高了可以升级到256G内存，目前一套...

本文介绍了如何在Linux系统上安装Omicverse的Docker版本。Omicverse是一个基于Python的高通量测序数据分析框架，具有统一输入输出和改进的可视化功能。作者首先尝试通过conda和pip方式安装，但...

系统：ubuntu20.04 创建挂载目录 sudo mkdir /mnt/data 磁盘查看磁盘信息 # 列出磁盘 lsblk # 查看磁盘UUID sudo blkid ### 输出中找到自己想挂载的磁盘，比如下面这个 ### /dev/sda1: LABEL='d...