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“归一化”与“标准化”
参考链接: https://mp.weixin.qq.com/s/6ioR3JE0wKg6M-YAsLBcTA 关于归一化和标准化的翻译看了很多中文资料,发现还是有争议的,在seurat中主要是两个函数:NormalizeData()和ScaleData() ,其...
.rds和.Rdata(.rda)
.rds和.Rdata (也称为.rda )文件都可用于以R本机格式存储R对象。与非本机存储方法(例如write.table相比,保存此方法有多个优点: 1)将数据恢复到R更快 2)它保持在数据中编码的R...
scRNA-seq简介-HBC lesson 1
参考链接: https://github.com/hbctraining/scRNA-seq_online/blob/master/lessons/01_intro_to_scRNA-seq.md 我们为什么需要单细胞RNA测序 人类各种组织之间细胞的类型,状态和相互作用差异巨...
QC(质控)-HBC lesson 4
QC(质控)-HBC lesson 4 在这一章你将会学到: 构建质控指标并使用相关图像可视化数据质量 估算质控指标并设置阈值去除低质量的细胞 单细胞数据分析流程的每个步骤都有这自己的目标和挑战。对...
EHJ:Lumican通过H3组蛋白乳酸化促进CAVD
本研究探讨了Lumican(LUM)在钙化主动脉瓣病(CAVD)中的作用。通过单细胞RNA测序分析发现,LUM在VICs的转变中发挥关键作用,并促进H3组蛋白乳酸化,进而加速钙化过程。去除LUM可改善钙化情况...
本地部署Deepseek-R1+知识库构建
本文介绍了在本地部署Deepseek-R1模型并构建知识库的步骤,主要分为五个部分。首先,用户需要安装Ollama软件,并通过命令行下载所需的模型。接着,通过访问指定的本地端口,可以在浏览器中查看...
通过注释文件计算线粒体序列比例
经验证,人类样本的单细胞分析使用seurat教程的方法计算线粒体序列比例与此方法结果一致,但对于其他物种,建议使用此方法。 使用注释文件生成线粒体计数指标 我们将使用AnnotationHub,它允许...
蛋白质-核酸相互作用
报告基因Assay 报告基因:是一种编码可被检测的蛋白质或酶的基因,也就是说,是一个其表达产物非常容易被鉴定的基因。把它的编码序列和基因表达调节序列相融合形成嵌合基因,或与其它目的基因相...
主动脉瓣组织学分层蛋白组学图谱
本研究通过多组学映射生成主动脉瓣的分子图谱,揭示了驱动钙化性主动脉瓣病(CAVD)疾病的网络。研究将瓣膜组织分为正常、纤维化和钙化三个区,分析组学数据并进行免疫荧光验证,发现转录组与蛋...















啦噜噜3个月前0
发现宝藏collagen4个月前0
好久不见,学长工作了吗?还是在读博?miaomiaomiao2年前0
回顾一下LBL2年前0
不错👍KT2年前0
汝甚秀,吾不及汝LBL2年前0
太强了 优秀KT2年前0
确实xmq2年前0
太棒了,之前用的等候回答卡的要死,还动不动显示error,这个真的反应很快!