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通过注释文件计算线粒体序列比例
经验证,人类样本的单细胞分析使用seurat教程的方法计算线粒体序列比例与此方法结果一致,但对于其他物种,建议使用此方法。 使用注释文件生成线粒体计数指标 我们将使用AnnotationHub,它允许...
单细胞聚类resolution参数的选择
在进行细胞聚类时有两个参数的选择对下游分析的结果影响很大 一个是纳入分析的PCs数,也就是dims参数,选择方法见 关于“数据的维度”(dims参数)的选择 ; 另一个是resolution参数,官方推荐根...
.rds和.Rdata
.rds和.Rdata (也称为.rda )文件都可用于以R本机格式存储R对象。与非本机存储方法(例如write.table相比,保存此方法有多个优点: 1)将数据恢复到R更快 2)它保持在数据中编码的R特定信息(例...
Circulation:重激活氧化的sGC作为减缓AVS进展的新治疗策略
本研究探讨了通过重新激活氧化状态下的可溶性鸟苷酸环化酶(sGC)作为一种减缓钙化性主动脉瓣狭窄(FCAVS)进展的新治疗策略。FCAVS是一种常见于老年人的心血管疾病,现有药物治疗效果有限,目...
主动脉瓣组织学分层蛋白组学图谱
本研究通过多组学映射生成主动脉瓣的分子图谱,揭示了驱动钙化性主动脉瓣病(CAVD)疾病的网络。研究将瓣膜组织分为正常、纤维化和钙化三个区,分析组学数据并进行免疫荧光验证,发现转录组与蛋...
流式细胞术简介
流式细胞术(Flow Cytometry,FCM,FACS)是以流式细胞仪为检测手段的一项能快速、精确的对单个细胞(或生物学颗粒)的理化特性进行多参数定量分析和分选的技术。 流式细胞仪的结构和原理 分析型...
Circulation:主动脉瓣钙化是由ALDH1A1的丧失引起的,并且可以通过视黄酸受体α的激动剂来预防
本研究探讨了主动脉瓣钙化的机制以及潜在的预防策略。研究发现,ALDH1A1基因在钙化的主动脉瓣膜中显著下调,其缺失可能促使瓣膜间质细胞向成骨样表型转变,从而加速钙化进程。此外,TGF-β1通过...
蛋白质-蛋白质相互作用
酵母双杂交(yeast two-hybrid) 酵母双杂交系统是在真核模式生物酵母中进行的,研究活细胞内蛋白质相互作用,是一种具有很高灵敏度的研究蛋白质之间关系的技术。 当我们将已知基因编码的蛋白作...
cellranger的安装
新建一个文件夹 打开linux终端,运行 mkdir yard 验证一下工作目录 pwd /home/vamond/yard 进入该目录,新建apps文件夹,用于存放cellreanger cd /mnt/home/user.name/yard mkdir apps cd apps ...
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啦噜噜11个月前0
发现宝藏miaomiaomiao3年前0
回顾一下LBL3年前0
不错👍KT3年前0
汝甚秀,吾不及汝LBL3年前0
太强了 优秀KT3年前0
确实xmq3年前0
太棒了,之前用的等候回答卡的要死,还动不动显示error,这个真的反应很快!xmq3年前0
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