本研究探讨了氧化低密度脂蛋白（oxLDL）诱导的转录因子FOXS1在钙化性主动脉瓣疾病（CAVD）中的作用。研究表明，oxLDL通过激活FOXS1导致胆固醇转运功能障碍，从而引发瓣膜间质细胞（VICs）的成骨...

前言 最近在学习单细胞转录组的上游分析，不得已安装了ubuntu18.04系统，第一次使用linux，怪不习惯的，而且很多在win10平台下很方便的功能在linux下找到替代会稍微费点精力。 比如我习惯后台跑...

最近由于CPU、内存等降价明显，自己配了一台洋垃圾，双路E5-2696V3, 36核72线程+128G内存，用来学习linux系统和生信分析，自己用目前是足够了，后续如果需求提高了可以升级到256G内存，目前一套...

本文详细记录了在Linux系统上安装COMPASS软件的过程，COMPASS是一款用于单细胞转录组代谢流分析的软件。首先，需要创建一个Python 3.9或3.10的conda环境，并确保pandas版本低于2.0.0。接着，安...

关于“数据的维度”(dims参数)的选择 Created time: Apr 13, 2021 12:07 PM Tags: R, Seurat, scRNA-seq 完成PCA之后，我们获得了该数据集的所有主成分（PCs）信息，但是如何决定纳入多少个主成...

本研究致力于探讨主动脉瓣功能及其与主动脉瓣狭窄（AS）风险相关的遗传变异。通过对UK Biobank中62902名参与者进行相差心血管磁共振成像（cMRI），结合深度学习技术，自动提取了三项关键的生理...

本文介绍了如何使用杏仁AI创意工坊生成个性化艺术二维码，包括进入艺术二维码页面、使用模板生成和自定义生成的操作流程，让二维码更具特色，增加记忆点。

QC（质控）-HBC lesson 4 在这一章你将会学到： 构建质控指标并使用相关图像可视化数据质量 估算质控指标并设置阈值去除低质量的细胞 单细胞数据分析流程的每个步骤都有这自己的目标和挑战。对...

经验证，人类样本的单细胞分析使用seurat教程的方法计算线粒体序列比例与此方法结果一致，但对于其他物种，建议使用此方法。 使用注释文件生成线粒体计数指标 我们将使用AnnotationHub，它允许...

准备工作：下载参考基因组和数据集 下载参考基因组 # 新建一个ref文件夹存放参考基因组 cd yard mkdir ref cd ref # 下载human GRCH38，大约11G wget https://cf.10xgenomics.com/supp/cell-exp...