"Linux笔记" ubuntu ​​ 在用户主目录下有一个 .bashrc 隐藏文件，可以在此文件中加入 PATH 的设置如下： sudo vim ~/.bashrc 加入： export PATH=<你的要加入的路径>:$PATH e...

Harmony方法在2019年发表在上面nature methods， harmony算法与其他整合算法相比的优势： 整合数据的同时对稀有细胞的敏感性依然很好； 省内存； 适合于更复杂的单细胞分析实验设计，可以比较来...

本研究探讨了氧化低密度脂蛋白（oxLDL）诱导的转录因子FOXS1在钙化性主动脉瓣疾病（CAVD）中的作用。研究表明，oxLDL通过激活FOXS1导致胆固醇转运功能障碍，从而引发瓣膜间质细胞（VICs）的成骨...

酵母双杂交（yeast two-hybrid） 酵母双杂交系统是在真核模式生物酵母中进行的，研究活细胞内蛋白质相互作用，是一种具有很高灵敏度的研究蛋白质之间关系的技术。 当我们将已知基因编码的蛋白作...

本文探讨了鞘氨醇-1-磷酸（S1P）信号通路在主动脉瓣疾病（AVD）进展中的作用。研究显示，随着人口老龄化，AVD 在老年人群中日益普遍，现有的治疗手段主要限于瓣膜置换，缺乏有效的药物干预。本...

准备工作：下载参考基因组和数据集 下载参考基因组 # 新建一个ref文件夹存放参考基因组 cd yard mkdir ref cd ref # 下载human GRCH38，大约11G wget https://cf.10xgenomics.com/supp/cell-exp...

基本技术 细胞的分离和原代培养 猪VICs的分离培养（以我自己使用的原代细胞为例） 将4-6月龄的猪使用丙泊酚诱导麻醉后，静脉注射氯化钾处死； 开胸后分离结扎主动脉、上腔静脉、下腔静脉，摘除...

目标： 确定每个类群的基因标记物 使用标记物识别每个类群的细胞类型 根据细胞类型标记物来判断是否需要重新分组，或许需要合并或拆分聚类的类群 挑战： 对结果的过度解读 结合不同类型的标记物...