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.rds和.Rdata(.rda)-香草杏仁

.rds和.Rdata(.rda)

​​ ​.rds​和.Rdata​ (也称为.rda​ )文件都可用于以R本机格式存储R对象。与非本机存储方法(例如write.table相比,保存此方法有多个优点: 1)将数据恢复到R更快 2)它保持在数据中编码的R...
生信分析环境配置:conda-香草杏仁

生信分析环境配置:conda

最近由于CPU、内存等降价明显,自己配了一台洋垃圾,双路E5-2696V3, 36核72线程+128G内存,用来学习linux系统和生信分析,自己用目前是足够了,后续如果需求提高了可以升级到256G内存,目前一套...
细胞培养基及添加剂的一些知识-香草杏仁

细胞培养基及添加剂的一些知识

培养基的基本成分 血清 血清是白蛋白、生长因子和生长抑制剂的复杂混合物,可能是细胞培养基中最重要的成分之一。最常用的血清是胎牛血清(FBS)。其他可用的血清类型包括新生小牛血清和马血清...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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Circulation:重激活氧化的sGC作为减缓AVS进展的新治疗策略-香草杏仁

Circulation:重激活氧化的sGC作为减缓AVS进展的新治疗策略

本研究探讨了通过重新激活氧化状态下的可溶性鸟苷酸环化酶(sGC)作为一种减缓钙化性主动脉瓣狭窄(FCAVS)进展的新治疗策略。FCAVS是一种常见于老年人的心血管疾病,现有药物治疗效果有限,目...
下载sra文件(多线程高速版) download_sra.sh-香草杏仁

下载sra文件(多线程高速版) download_sra.sh

这篇文章介绍了一个多线程下载NCBI数据库中SRA文件的脚本download_sra.sh。使用前需要确认已安装sra-tools。该脚本通过prefetch命令,可以高效地下载各种SRA文件,包括bulk-seq和single cell原...
Nature Genetics:主动脉瓣功能及主动脉瓣狭窄风险相关遗传变异的多性状分析研究-香草杏仁

Nature Genetics:主动脉瓣功能及主动脉瓣狭窄风险相关遗传变异的多性状分析研究

本研究致力于探讨主动脉瓣功能及其与主动脉瓣狭窄(AS)风险相关的遗传变异。通过对UK Biobank中62902名参与者进行相差心血管磁共振成像(cMRI),结合深度学习技术,自动提取了三项关键的生理...
通过注释文件计算线粒体序列比例-香草杏仁

通过注释文件计算线粒体序列比例

经验证,人类样本的单细胞分析使用seurat教程的方法计算线粒体序列比例与此方法结果一致,但对于其他物种,建议使用此方法。 使用注释文件生成线粒体计数指标 我们将使用AnnotationHub,它允许...
本地部署Deepseek-R1+知识库构建-香草杏仁

本地部署Deepseek-R1+知识库构建

本文介绍了在本地部署Deepseek-R1模型并构建知识库的步骤,主要分为五个部分。首先,用户需要安装Ollama软件,并通过命令行下载所需的模型。接着,通过访问指定的本地端口,可以在浏览器中查看...
主动脉瓣组织学分层蛋白组学图谱-香草杏仁

主动脉瓣组织学分层蛋白组学图谱

本研究通过多组学映射生成主动脉瓣的分子图谱,揭示了驱动钙化性主动脉瓣病(CAVD)疾病的网络。研究将瓣膜组织分为正常、纤维化和钙化三个区,分析组学数据并进行免疫荧光验证,发现转录组与蛋...
Circulation:动脉钙化与瓣膜钙化的EVs多组学揭示特异调控因子-香草杏仁

Circulation:动脉钙化与瓣膜钙化的EVs多组学揭示特异调控因子

通过全组织蛋白质组学和组织EV囊泡组学,研究发现动脉钙化和瓣膜钙化具有不同的驱动因素。进一步分析揭示了颈动脉斑块和AV钙化组织中的关键蛋白,涉及细胞粘附、迁移、炎症、补体级联反应等途径...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond2年前
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