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归一化与主成分分析-HBC lesson 5-香草杏仁

归一化与主成分分析-HBC lesson 5

在我们我们获得高质量的单细胞数据后,单细胞RNA测序分析工作流程的下一步是进行聚类。聚类的目标是将不同的细胞类型分离成独特的细胞群。为了执行聚类,我们需要确定细胞间表达差异最大的基因...
流式细胞术简介-香草杏仁

流式细胞术简介

流式细胞术(Flow Cytometry,FCM,FACS)是以流式细胞仪为检测手段的一项能快速、精确的对单个细胞(或生物学颗粒)的理化特性进行多参数定量分析和分选的技术。 流式细胞仪的结构和原理 分析型...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond4年前
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Circulation: 靶向鞘氨醇-1-磷酸信号通路以防止主动脉瓣疾病的进展-香草杏仁

Circulation: 靶向鞘氨醇-1-磷酸信号通路以防止主动脉瓣疾病的进展

本文探讨了鞘氨醇-1-磷酸(S1P)信号通路在主动脉瓣疾病(AVD)进展中的作用。研究显示,随着人口老龄化,AVD 在老年人群中日益普遍,现有的治疗手段主要限于瓣膜置换,缺乏有效的药物干预。本...
细胞生物学技术考前参考-香草杏仁

细胞生物学技术考前参考

核心重点(非官方) 选择题 高严格度条件 不同离心方法的适用性 沉降系数、离心力与什么因素有关? 转录因子重编程 检测细胞增殖或凋亡的手段及检测方法 流式的几个对照组 名词解释 透射电子与...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond4年前
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本地部署Deepseek-R1+知识库构建-香草杏仁

本地部署Deepseek-R1+知识库构建

本文介绍了在本地部署Deepseek-R1模型并构建知识库的步骤,主要分为五个部分。首先,用户需要安装Ollama软件,并通过命令行下载所需的模型。接着,通过访问指定的本地端口,可以在浏览器中查看...
单细胞聚类resolution参数的选择-香草杏仁

单细胞聚类resolution参数的选择

在进行细胞聚类时有两个参数的选择对下游分析的结果影响很大 一个是纳入分析的PCs数,也就是dims参数,选择方法见 关于“数据的维度”(dims参数)的选择 ; 另一个是resolution参数,官方推荐根...
MJ绘画基础教程--part1 🎨文生图的创作流程参考-香草杏仁

MJ绘画基础教程–part1 🎨文生图的创作流程参考

本文介绍了使用文生图进行绘画的流程,包括输入描述词、选择AI模型、设置尺寸、添加参考图、选择参数等步骤。同时提到了混合图片的方法和咒语解析过程,全面指导新手如何利用文生图进行创作。
Vamond的头像-香草杏仁Vamond1年前
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对Seurat对象使用harmony方法整合-香草杏仁

对Seurat对象使用harmony方法整合

Harmony方法在2019年发表在上面nature methods, harmony算法与其他整合算法相比的优势: 整合数据的同时对稀有细胞的敏感性依然很好; 省内存; 适合于更复杂的单细胞分析实验设计,可以比较来...
细胞培养的基本技术与知识-香草杏仁

细胞培养的基本技术与知识

基本技术 细胞的分离和原代培养 猪VICs的分离培养(以我自己使用的原代细胞为例) 将4-6月龄的猪使用丙泊酚诱导麻醉后,静脉注射氯化钾处死; 开胸后分离结扎主动脉、上腔静脉、下腔静脉,摘除...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond4年前
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蛋白质-核酸相互作用-香草杏仁

蛋白质-核酸相互作用

报告基因Assay 报告基因:是一种编码可被检测的蛋白质或酶的基因,也就是说,是一个其表达产物非常容易被鉴定的基因。把它的编码序列和基因表达调节序列相融合形成嵌合基因,或与其它目的基因相...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond4年前
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