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CVR:FOXS1介导胆固醇转运失调驱动主动脉瓣钙化研究-香草杏仁

CVR:FOXS1介导胆固醇转运失调驱动主动脉瓣钙化研究

本研究探讨了氧化低密度脂蛋白(oxLDL)诱导的转录因子FOXS1在钙化性主动脉瓣疾病(CAVD)中的作用。研究表明,oxLDL通过激活FOXS1导致胆固醇转运功能障碍,从而引发瓣膜间质细胞(VICs)的成骨...
Resistin: Potential biomarker and therapeutic target in atherosclerosis-香草杏仁

Resistin: Potential biomarker and therapeutic target in atherosclerosis

Zhou, Li, Jun-Yi Li, Ping-Ping He, Xiao-Hua Yu, and Chao-Ke Tang. “Resistin: Potential Biomarker and Therapeutic Target in Atherosclerosis.” Clinica Chimica Acta; International J...
归一化与主成分分析-HBC lesson 5-香草杏仁

归一化与主成分分析-HBC lesson 5

在我们我们获得高质量的单细胞数据后,单细胞RNA测序分析工作流程的下一步是进行聚类。聚类的目标是将不同的细胞类型分离成独特的细胞群。为了执行聚类,我们需要确定细胞间表达差异最大的基因...
linux添加环境变量-香草杏仁

linux添加环境变量

"Linux笔记" ubuntu ​​ 在用户主目录下有一个 .bashrc 隐藏文件,可以在此文件中加入 PATH 的设置如下: sudo vim ~/.bashrc 加入: export PATH=<你的要加入的路径>:$PATH e...
细胞聚类的质控-HBC lesson 8-香草杏仁

细胞聚类的质控-HBC lesson 8

学习内容 评估是否存在聚类的假象 用PCA和UMAP图来确定聚类的质量,并了解何时需要重新聚类 评估已知的细胞类型标志物以假设集群的细胞类型身份 目标 确定集群是否代表真正的细胞类型或由于生物...
ubuntu 设置自动挂载磁盘-香草杏仁

ubuntu 设置自动挂载磁盘

系统:ubuntu20.04 创建挂载目录 sudo mkdir /mnt/data 磁盘查看磁盘信息 # 列出磁盘 lsblk # 查看磁盘UUID sudo blkid ### 输出中找到自己想挂载的磁盘,比如下面这个 ### /dev/sda1: LABEL='d...

windows R 内存管理

在做单细胞数据分析的时候习惯生成和保存很多中间变量,以便于debug的时候方便直接读取某一个中间变量进行后续分析。这些变量包括很多seurat object,对于多样本整合的数据来讲最后会很大,每次...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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Seurat基本分析流程-香草杏仁

Seurat基本分析流程

参考链接: https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial.html 建立 Seurat 对象 示例数据为10X Genomics的外周血单个核细胞(PBMC)数据集,含有2700个单细胞,使用Illumina NextSeq...
ChatGPT香草杏仁版-香草杏仁

ChatGPT香草杏仁版

2023. 3. 24 更新!最新版本的ChatGPT已经更新,重新部署并选择了轻量版以提高性能。基于github开源项目,免费使用,无需科学上网。加入密钥验证以避免滥用,仅限本站访客使用。使用API时可选择...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond3年前
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电镜技术-香草杏仁

电镜技术

电镜技术 电子显微镜以电子射线作为照明光源,以电磁场作为透镜,具有高分辨率和放大倍率的显微镜。电镜用于研究组织和细胞的超微结构。 电子与样品作用后产生的电子信号主要有:透射电子和二次...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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