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cellranger的安装
新建一个文件夹 打开linux终端,运行 mkdir yard 验证一下工作目录 pwd /home/vamond/yard 进入该目录,新建apps文件夹,用于存放cellreanger cd /mnt/home/user.name/yard mkdir apps cd apps ...
Circulation:主动脉瓣钙化是由ALDH1A1的丧失引起的,并且可以通过视黄酸受体α的激动剂来预防
本研究探讨了主动脉瓣钙化的机制以及潜在的预防策略。研究发现,ALDH1A1基因在钙化的主动脉瓣膜中显著下调,其缺失可能促使瓣膜间质细胞向成骨样表型转变,从而加速钙化进程。此外,TGF-β1通过...
.rds和.Rdata(.rda)
.rds和.Rdata (也称为.rda )文件都可用于以R本机格式存储R对象。与非本机存储方法(例如write.table相比,保存此方法有多个优点: 1)将数据恢复到R更快 2)它保持在数据中编码的R...
整合后的细胞标记物鉴别-HBC lesson 9
目标: 确定每个类群的基因标记物 使用标记物识别每个类群的细胞类型 根据细胞类型标记物来判断是否需要重新分组,或许需要合并或拆分聚类的类群 挑战: 对结果的过度解读 结合不同类型的标记物...
windows R 内存管理
在做单细胞数据分析的时候习惯生成和保存很多中间变量,以便于debug的时候方便直接读取某一个中间变量进行后续分析。这些变量包括很多seurat object,对于多样本整合的数据来讲最后会很大,每次...
分析准备与读取数据-HBC lesson 3
本篇教程将会帮助你理解如何获得单细胞RNA测序实验中的数据。 基因表达定量完成之后,我们需要将这些数据导入R中,以生成可用于执行质控的矩阵。在本课中,我们将讨论计数数据可被导入的格式,...
从原始数据到表达矩阵-HBC lesson 2
根据所使用的建库方法,单细胞的RNA序列(也称为读取(reads)或标签(tags))将从转录本的3'端(或5'端)(10X Genomics,CEL-seq2,Drop-seq,inDrops)或全长转录本(Smart-seq)获得。 参...
细胞培养基及添加剂的一些知识
培养基的基本成分 血清 血清是白蛋白、生长因子和生长抑制剂的复杂混合物,可能是细胞培养基中最重要的成分之一。最常用的血清是胎牛血清(FBS)。其他可用的血清类型包括新生小牛血清和马血清...
Ubuntu防火墙配置
Created time: December 22, 2021 7:49 PM 参考链接: https://blog.csdn.net/willingtolove/article/details/109863064 Ubuntu系统默认是安装了ufw防火墙的。查看防火墙的状态: sudo ufw ...
ATVB:空间与单细胞图谱揭示CAVD中VIC与巨噬细胞的性别差异
该研究整合人主动脉瓣组织学、单细胞RNA测序、Visium空间转录组及RNA-FISH,描绘CAVD中VIC与巨噬细胞的性别偏倚状态。男性组织呈更高钙化负荷并有COMP阳性细胞靠近钙化灶,女性组织SERPINE1阳性...















啦噜噜1年前0
发现宝藏miaomiaomiao3年前0
回顾一下LBL3年前0
不错👍KT3年前0
汝甚秀,吾不及汝LBL3年前0
太强了 优秀KT3年前0
确实xmq3年前0
太棒了,之前用的等候回答卡的要死,还动不动显示error,这个真的反应很快!xmq3年前0
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