香草杏仁 - 个人学习生活笔记-最新发布-第7页

Resistin: Potential biomarker and therapeutic target in atherosclerosis

Zhou, Li, Jun-Yi Li, Ping-Ping He, Xiao-Hua Yu, and Chao-Ke Tang. “Resistin: Potential Biomarker and Therapeutic Target in Atherosclerosis.” Clinica Chimica Acta; International J...

文献笔记 # 细胞 # 表达 # 抵抗素

Vamond3年前

049890

.rds和.Rdata（.rda）

.rds和.Rdata （也称为.rda ）文件都可用于以R本机格式存储R对象。与非本机存储方法（例如write.table相比，保存此方法有多个优点： 1)将数据恢复到R更快 2)它保持在数据中编码的R...

R基础生信基础 # 存储 # 方法 # 例如

Vamond3年前

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windows R 内存管理

在做单细胞数据分析的时候习惯生成和保存很多中间变量，以便于debug的时候方便直接读取某一个中间变量进行后续分析。这些变量包括很多seurat object，对于多样本整合的数据来讲最后会很大，每次...

R基础 # R

Vamond5年前

050980

流式细胞术简介

流式细胞术（Flow Cytometry，FCM，FACS）是以流式细胞仪为检测手段的一项能快速、精确的对单个细胞(或生物学颗粒)的理化特性进行多参数定量分析和分选的技术。流式细胞仪的结构和原理分析型...

实验技术 # biotech

Vamond5年前

171720

整合-HBC lesson 6.2

本文主要是翻译，用作参考，还是要看GitHub上的英文原版学习目标对于不同条件下的样本，将相同类型的细胞对齐到一起挑战对准类似的细胞类型，这样我们就不会因为样品、条件、模式或批次的不...

单细胞 # R # scRNA-seq # Seurat

Vamond5年前

051400

🌟立即升级你的链接！打造个性化艺术二维码！

本文介绍了如何使用杏仁AI创意工坊生成个性化艺术二维码，包括进入艺术二维码页面、使用模板生成和自定义生成的操作流程，让二维码更具特色，增加记忆点。

AI # 杏仁AI # 艺术二维码 # 个性化

Vamond2年前

04220

聚类分析-HBC lesson 7

学习内容学会选择合适的PCs用于聚类分析聚类的方法目标产生细胞类型特异性聚类，并使用已知的细胞类型标记基因来确定聚类的身份。确定集群是否代表真正的细胞类型或由于生物或技术差异而产...

单细胞 # R # scRNA-seq # Seurat

Vamond5年前

055500

“归一化”与“标准化”

参考链接: https://mp.weixin.qq.com/s/6ioR3JE0wKg6M-YAsLBcTA 关于归一化和标准化的翻译看了很多中文资料，发现还是有争议的，在seurat中主要是两个函数：NormalizeData()和ScaleData() ，其...

R基础单细胞 # R

Vamond5年前

055840

A disease-driver population within interstitial cells of human calcific aortic valves identified via single-cell and proteomic profiling （Cell Reports IF=9.4）

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文献笔记 # 钙化 # 细胞 # 表达

Vamond3年前

052960

cellranger count 流程

准备工作：下载参考基因组和数据集下载参考基因组 # 新建一个ref文件夹存放参考基因组 cd yard mkdir ref cd ref # 下载human GRCH38，大约11G wget https://cf.10xgenomics.com/supp/cell-exp...

单细胞

Vamond5年前

059310

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