这篇文章介绍了一个多线程下载NCBI数据库中SRA文件的脚本download_sra.sh。使用前需要确认已安装sra-tools。该脚本通过prefetch命令，可以高效地下载各种SRA文件，包括bulk-seq和single cell原...

本文介绍了在本地部署Deepseek-R1模型并构建知识库的步骤，主要分为五个部分。首先，用户需要安装Ollama软件，并通过命令行下载所需的模型。接着，通过访问指定的本地端口，可以在浏览器中查看...

流式细胞术（Flow Cytometry，FCM，FACS）是以流式细胞仪为检测手段的一项能快速、精确的对单个细胞(或生物学颗粒)的理化特性进行多参数定量分析和分选的技术。 流式细胞仪的结构和原理 分析型...

在保持细胞结构完整的条件下，借助细胞中的化学反应在细胞原位确定化学成分的分布、量及其在细胞活动中的动态变化的技术，达到定性、定位和相对定量的目的，用以阐明化学成分在细胞中的功能、与...

本研究探讨了通过重新激活氧化状态下的可溶性鸟苷酸环化酶（sGC）作为一种减缓钙化性主动脉瓣狭窄（FCAVS）进展的新治疗策略。FCAVS是一种常见于老年人的心血管疾病，现有药物治疗效果有限，目...

Yin 等结合人主动脉瓣基质蛋白质组、糖蛋白组、细胞实验及遗传小鼠模型，揭示非钙化区与钙化区的 VCAN/ACAN 组成差异，以及 ADAMTS5 活性缺失背景下的蛋白聚糖积聚和瓣膜功能障碍。本文逐图梳理...

本研究旨在探讨二叶式主动脉瓣（BAV）的基因组和转录组学特征，以揭示其遗传机制。BAV 是一种常见的先天性心脏缺陷，尽管其遗传性较强，但目前已知的单基因突变仅能解释部分病例。为了解决这一...

学习内容 评估是否存在聚类的假象 用PCA和UMAP图来确定聚类的质量，并了解何时需要重新聚类 评估已知的细胞类型标志物以假设集群的细胞类型身份 目标 确定集群是否代表真正的细胞类型或由于生物...

关于“数据的维度”(dims参数)的选择 Created time: Apr 13, 2021 12:07 PM Tags: R, Seurat, scRNA-seq 完成PCA之后，我们获得了该数据集的所有主成分（PCs）信息，但是如何决定纳入多少个主成...

​​ 首先注意 usr 指 Unix System Resource​，而不是user /usr/bin​：系统预装的一些可执行程序，随系统升级会改变 ​/usr/local/bin​：用户安装的可执行程序，不受系统升级影响，用户编译...