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CVR:FOXS1介导胆固醇转运失调驱动主动脉瓣钙化研究-香草杏仁

CVR:FOXS1介导胆固醇转运失调驱动主动脉瓣钙化研究

本研究探讨了氧化低密度脂蛋白(oxLDL)诱导的转录因子FOXS1在钙化性主动脉瓣疾病(CAVD)中的作用。研究表明,oxLDL通过激活FOXS1导致胆固醇转运功能障碍,从而引发瓣膜间质细胞(VICs)的成骨...
细胞化学技术-香草杏仁

细胞化学技术

在保持细胞结构完整的条件下,借助细胞中的化学反应在细胞原位确定化学成分的分布、量及其在细胞活动中的动态变化的技术,达到定性、定位和相对定量的目的,用以阐明化学成分在细胞中的功能、与...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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使用singleR预测细胞类型-香草杏仁

使用singleR预测细胞类型

SingleR是用于单细胞RNA测序(scRNAseq)数据的自动注释方法(Aran et al.2019)。给定具有已知标签的样本(单细胞或RNAseq)参考数据集,它将基于与参考数据的相似性标记测试数据集中的新细胞...
MJ绘画基础教程--part2🖌️生图之后的进一步操作-香草杏仁

MJ绘画基础教程–part2🖌️生图之后的进一步操作

本文介绍了在MJ绘画基础教程中,针对生图进行进一步操作的方法,包括单张放大、微调、倍数放大、图像变化、细化局部、拓展和平移等技术。通过这些操作,可以对图片进行精细处理和扩展,以达到更...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond2年前
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安装omicverse docker版-香草杏仁

安装omicverse docker版

本文介绍了如何在Linux系统上安装Omicverse的Docker版本。Omicverse是一个基于Python的高通量测序数据分析框架,具有统一输入输出和改进的可视化功能。作者首先尝试通过conda和pip方式安装,但...

“归一化”与“标准化”

参考链接: https://mp.weixin.qq.com/s/6ioR3JE0wKg6M-YAsLBcTA 关于归一化和标准化的翻译看了很多中文资料,发现还是有争议的,在seurat中主要是两个函数:NormalizeData()和ScaleData() ,其...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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关于“数据的维度”(dims参数)的选择-香草杏仁

关于“数据的维度”(dims参数)的选择

关于“数据的维度”(dims参数)的选择 Created time: Apr 13, 2021 12:07 PM Tags: R, Seurat, scRNA-seq 完成PCA之后,我们获得了该数据集的所有主成分(PCs)信息,但是如何决定纳入多少个主成...
Aspera批量下载fastq或sra文件(EBI数据库)-香草杏仁

Aspera批量下载fastq或sra文件(EBI数据库)

本文介绍了如何通过Aspera工具批量下载EBI数据库中的fastq或sra文件。首先,用户需通过conda创建一个新的环境并安装Aspera CLI和sra-tools。在获取到目标文件的下载链接后,可以使用Aspera命令...
生信分析环境搭建--conda+jupyter-香草杏仁

生信分析环境搭建–conda+jupyter

本文介绍了如何使用conda和jupyter notebook搭建生信分析环境,包括安装配置conda、jupyter notebook、scanpy等工具,并演示了在jupyter notebook中调用不同环境的方法。