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EHJ：Lumican通过H3组蛋白乳酸化促进CAVD
本研究探讨了Lumican（LUM）在钙化主动脉瓣病（CAVD）中的作用。通过单细胞RNA测序分析发现，LUM在VICs的转变中发挥关键作用，并促进H3组蛋白乳酸化，进而加速钙化过程。去除LUM可改善钙化情况...
2年前
Seurat基本分析流程
参考链接: https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial.html 建立 Seurat 对象 示例数据为10X Genomics的外周血单个核细胞（PBMC）数据集，含有2700个单细胞，使用Illumina NextSeq...
5年前
Aspera批量下载fastq或sra文件（EBI数据库）
本文介绍了如何通过Aspera工具批量下载EBI数据库中的fastq或sra文件。首先，用户需通过conda创建一个新的环境并安装Aspera CLI和sra-tools。在获取到目标文件的下载链接后，可以使用Aspera命令...
1年前
linux常用命令：tar
Linux tar（英文全拼：tape archive ）命令用于备份文件。 tar是用来建立，还原备份文件的工具程序，它可以加入，解开备份文件内的文件。 备份文件不完全等同于压缩文件，linux中的备...
3年前Seurat安装
从CRAN安装最新版 4.0+seurat需要R也是4.0+的版本 Seurat is available on CRAN for all platforms. To install, run: # Enter commands in R (or R studio, if installed) install.packages(&#...
5年前
linux中的usr和bin目录
首先注意 usr 指 Unix System Resource，而不是user /usr/bin：系统预装的一些可执行程序，随系统升级会改变 /usr/local/bin：用户安装的可执行程序，不受系统升级影响，用户编译...
3年前
蛋白质-核酸相互作用
报告基因Assay 报告基因：是一种编码可被检测的蛋白质或酶的基因，也就是说，是一个其表达产物非常容易被鉴定的基因。把它的编码序列和基因表达调节序列相融合形成嵌合基因，或与其它目的基因相...
5年前
conda的使用
conda的下载与安装 创建小环境并在其内安装软件 创建名为rna-seq的小环境 # conda create -n [名称]，后面是要安装的主要软件 conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y ...
3年前
单细胞转录组代谢流分析软件COMPASS&MEBOCOST安装
本文详细记录了在Linux系统上安装COMPASS软件的过程，COMPASS是一款用于单细胞转录组代谢流分析的软件。首先，需要创建一个Python 3.9或3.10的conda环境，并确保pandas版本低于2.0.0。接着，安...
2年前
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最新评论
啦噜噜1年前0
发现宝藏miaomiaomiao3年前0
回顾一下LBL3年前0
不错👍KT3年前0
汝甚秀，吾不及汝LBL3年前0
太强了 优秀KT3年前0
确实xmq3年前0
太棒了，之前用的等候回答卡的要死，还动不动显示error，这个真的反应很快！xmq3年前0
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