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ChatGPT香草杏仁版-香草杏仁

ChatGPT香草杏仁版

2023. 3. 24 更新!最新版本的ChatGPT已经更新,重新部署并选择了轻量版以提高性能。基于github开源项目,免费使用,无需科学上网。加入密钥验证以避免滥用,仅限本站访客使用。使用API时可选择...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond3年前
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windows R 内存管理

在做单细胞数据分析的时候习惯生成和保存很多中间变量,以便于debug的时候方便直接读取某一个中间变量进行后续分析。这些变量包括很多seurat object,对于多样本整合的数据来讲最后会很大,每次...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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cellranger count 流程-香草杏仁

cellranger count 流程

准备工作:下载参考基因组和数据集 下载参考基因组 # 新建一个ref文件夹存放参考基因组 cd yard mkdir ref cd ref # 下载human GRCH38,大约11G wget https://cf.10xgenomics.com/supp/cell-exp...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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Circulation:二叶式主动脉瓣的基因组与转录组学研究-香草杏仁

Circulation:二叶式主动脉瓣的基因组与转录组学研究

本研究旨在探讨二叶式主动脉瓣(BAV)的基因组和转录组学特征,以揭示其遗传机制。BAV 是一种常见的先天性心脏缺陷,尽管其遗传性较强,但目前已知的单基因突变仅能解释部分病例。为了解决这一...
电镜技术-香草杏仁

电镜技术

电镜技术 电子显微镜以电子射线作为照明光源,以电磁场作为透镜,具有高分辨率和放大倍率的显微镜。电镜用于研究组织和细胞的超微结构。 电子与样品作用后产生的电子信号主要有:透射电子和二次...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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整合后的细胞标记物鉴别-HBC lesson 9-香草杏仁

整合后的细胞标记物鉴别-HBC lesson 9

目标: 确定每个类群的基因标记物 使用标记物识别每个类群的细胞类型 根据细胞类型标记物来判断是否需要重新分组,或许需要合并或拆分聚类的类群 挑战: 对结果的过度解读 结合不同类型的标记物...
细胞化学技术-香草杏仁

细胞化学技术

在保持细胞结构完整的条件下,借助细胞中的化学反应在细胞原位确定化学成分的分布、量及其在细胞活动中的动态变化的技术,达到定性、定位和相对定量的目的,用以阐明化学成分在细胞中的功能、与...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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Aspera批量下载fastq或sra文件(EBI数据库)-香草杏仁

Aspera批量下载fastq或sra文件(EBI数据库)

本文介绍了如何通过Aspera工具批量下载EBI数据库中的fastq或sra文件。首先,用户需通过conda创建一个新的环境并安装Aspera CLI和sra-tools。在获取到目标文件的下载链接后,可以使用Aspera命令...
蛋白质-蛋白质相互作用-香草杏仁

蛋白质-蛋白质相互作用

酵母双杂交(yeast two-hybrid) 酵母双杂交系统是在真核模式生物酵母中进行的,研究活细胞内蛋白质相互作用,是一种具有很高灵敏度的研究蛋白质之间关系的技术。 当我们将已知基因编码的蛋白作...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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QC(质控)-HBC lesson 4-香草杏仁

QC(质控)-HBC lesson 4

QC(质控)-HBC lesson 4 在这一章你将会学到: 构建质控指标并使用相关图像可视化数据质量 估算质控指标并设置阈值去除低质量的细胞 单细胞数据分析流程的每个步骤都有这自己的目标和挑战。对...