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排序
使用singleR预测细胞类型
SingleR是用于单细胞RNA测序（scRNAseq）数据的自动注释方法（Aran et al.2019）。给定具有已知标签的样本（单细胞或RNAseq）参考数据集，它将基于与参考数据的相似性标记测试数据集中的新细胞...
5年前Seurat安装
从CRAN安装最新版 4.0+seurat需要R也是4.0+的版本 Seurat is available on CRAN for all platforms. To install, run: # Enter commands in R (or R studio, if installed) install.packages(&#...
5年前
linux常用命令：tar
Linux tar（英文全拼：tape archive ）命令用于备份文件。 tar是用来建立，还原备份文件的工具程序，它可以加入，解开备份文件内的文件。 备份文件不完全等同于压缩文件，linux中的备...
3年前
支持linux平台的截图神器flameshot
前言 最近在学习单细胞转录组的上游分析，不得已安装了ubuntu18.04系统，第一次使用linux，怪不习惯的，而且很多在win10平台下很方便的功能在linux下找到替代会稍微费点精力。 比如我习惯后台跑...
5年前
聚类分析-HBC lesson 7
学习内容 学会选择合适的PCs用于聚类分析 聚类的方法 目标 产生细胞类型特异性聚类，并使用已知的细胞类型标记基因来确定聚类的身份。 确定集群是否代表真正的细胞类型或由于生物或技术差异而产...
5年前
linux中的usr和bin目录
首先注意 usr 指 Unix System Resource，而不是user /usr/bin：系统预装的一些可执行程序，随系统升级会改变 /usr/local/bin：用户安装的可执行程序，不受系统升级影响，用户编译...
3年前
细胞工程
核酸导入技术 将特异的核酸(DNA或RNA)导入到真核细胞中 ，以研究蛋白特性、调控基因表达、调节细胞行为等 常用的核酸导入方法 化学方法：构建非病毒载体（脂质体、DEAE-葡聚糖法、磷酸钙法导入...
5年前
Nature Genetics：主动脉瓣功能及主动脉瓣狭窄风险相关遗传变异的多性状分析研究
本研究致力于探讨主动脉瓣功能及其与主动脉瓣狭窄（AS）风险相关的遗传变异。通过对UK Biobank中62902名参与者进行相差心血管磁共振成像（cMRI），结合深度学习技术，自动提取了三项关键的生理...
4个月前
整合后的细胞标记物鉴别-HBC lesson 9
目标： 确定每个类群的基因标记物 使用标记物识别每个类群的细胞类型 根据细胞类型标记物来判断是否需要重新分组，或许需要合并或拆分聚类的类群 挑战： 对结果的过度解读 结合不同类型的标记物...
5年前
生信分析环境配置：conda
最近由于CPU、内存等降价明显，自己配了一台洋垃圾，双路E5-2696V3, 36核72线程+128G内存，用来学习linux系统和生信分析，自己用目前是足够了，后续如果需求提高了可以升级到256G内存，目前一套...
3年前
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最新评论
啦噜噜12个月前0
发现宝藏miaomiaomiao3年前0
回顾一下LBL3年前0
不错👍KT3年前0
汝甚秀，吾不及汝LBL3年前0
太强了 优秀KT3年前0
确实xmq3年前0
太棒了，之前用的等候回答卡的要死，还动不动显示error，这个真的反应很快！xmq3年前0
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