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从原始数据到表达矩阵-HBC lesson 2
根据所使用的建库方法，单细胞的RNA序列（也称为读取（reads）或标签（tags））将从转录本的3'端（或5'端）（10X Genomics，CEL-seq2，Drop-seq，inDrops）或全长转录本（Smart-seq）获得。 参...
5年前细胞生物学技术考前参考
核心重点（非官方） 选择题 高严格度条件 不同离心方法的适用性 沉降系数、离心力与什么因素有关？ 转录因子重编程 检测细胞增殖或凋亡的手段及检测方法 流式的几个对照组 名词解释 透射电子与...
5年前
Nature Genetics：主动脉瓣功能及主动脉瓣狭窄风险相关遗传变异的多性状分析研究
本研究致力于探讨主动脉瓣功能及其与主动脉瓣狭窄（AS）风险相关的遗传变异。通过对UK Biobank中62902名参与者进行相差心血管磁共振成像（cMRI），结合深度学习技术，自动提取了三项关键的生理...
6个月前
ATVB：主动脉瓣狭窄的性别差异蛋白质组学
本文研究了钙化性主动脉瓣狭窄（AS）中血浆和组织蛋白质组的性别差异。通过LC-MS/ms技术，分析了32名男性和20名女性的血浆样本，发现20种循环蛋白在两性之间存在显著差异。男性的富集蛋白与急性...
1年前
Circulation：二叶式主动脉瓣的基因组与转录组学研究
本研究旨在探讨二叶式主动脉瓣（BAV）的基因组和转录组学特征，以揭示其遗传机制。BAV 是一种常见的先天性心脏缺陷，尽管其遗传性较强，但目前已知的单基因突变仅能解释部分病例。为了解决这一...
6个月前
使用Aspera高速下载ngs数据并进行MD5校验
因为课题研究需要结合参考一篇已发表的单细胞数据，由于该文章只提供的原始fastq文件，所有要下载下来从上游分析开始做起。（如果是是做数据库生信挖掘的也需要下载文件哦）一开始尝试的使用htt...
5年前
Circulation: 靶向鞘氨醇-1-磷酸信号通路以防止主动脉瓣疾病的进展
本文探讨了鞘氨醇-1-磷酸（S1P）信号通路在主动脉瓣疾病（AVD）进展中的作用。研究显示，随着人口老龄化，AVD 在老年人群中日益普遍，现有的治疗手段主要限于瓣膜置换，缺乏有效的药物干预。本...
1年前
细胞培养基及添加剂的一些知识
培养基的基本成分 血清 血清是白蛋白、生长因子和生长抑制剂的复杂混合物，可能是细胞培养基中最重要的成分之一。最常用的血清是胎牛血清（FBS）。其他可用的血清类型包括新生小牛血清和马血清...
5年前“归一化”与“标准化”
参考链接: https://mp.weixin.qq.com/s/6ioR3JE0wKg6M-YAsLBcTA 关于归一化和标准化的翻译看了很多中文资料，发现还是有争议的，在seurat中主要是两个函数：NormalizeData()和ScaleData() ，其...
5年前
ATVB：多组学揭示CAVD基质细胞状态变化与INHBA相关重塑
该研究整合胎儿、健康参照和钙化主动脉瓣单细胞图谱，并结合GWAS、bulk RNA-seq及体外功能实验，发现CAVD中炎症相关VDSC1和VDSC3显著扩增，遗传与疾病转录信号共同定位于VDSC，并筛出INHBA。敲...
1个月前
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最新评论
啦噜噜1年前0
发现宝藏miaomiaomiao3年前0
回顾一下LBL3年前0
不错👍KT3年前0
汝甚秀，吾不及汝LBL3年前0
太强了 优秀KT3年前0
确实xmq3年前0
太棒了，之前用的等候回答卡的要死，还动不动显示error，这个真的反应很快！xmq3年前0
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