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scRNA-seq数据整合Introduction-香草杏仁

scRNA-seq数据整合Introduction

Seurat不仅可以校正实验的批次效应,还能跨平台整合数据,例如将10x单细胞数据、BD单细胞数据和SMART单细胞数据整合在一起;也能整合单细胞多组学数据,例如将单细胞ATAC、空间转录组与单细胞转...
激光扫描共聚焦显微镜和超高分辨率显微镜-香草杏仁

激光扫描共聚焦显微镜和超高分辨率显微镜

分子标记物:荧光素 Fluophore 能够吸收能量并在释放能量的过程中发光,吸收短波长的能量后发射出长波长的光。当激发照射停止,发射光也消失 。荧光素都需要知道2个波长: 激发光波长(excitati...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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对Seurat对象使用harmony方法整合-香草杏仁

对Seurat对象使用harmony方法整合

Harmony方法在2019年发表在上面nature methods, harmony算法与其他整合算法相比的优势: 整合数据的同时对稀有细胞的敏感性依然很好; 省内存; 适合于更复杂的单细胞分析实验设计,可以比较来...
PromptGenius for ChatGPT | 多语言支持、便捷操作、定期更新的提示词面板-香草杏仁

PromptGenius for ChatGPT | 多语言支持、便捷操作、定期更新的提示词面板

这篇文本介绍了一款强大的提示词生成工具的功能特色,包括分类完善、热门提示词展示、多语言支持、便捷操作、定期更新和开箱即用等。点击下方按钮可直接使用!
Vamond的头像-香草杏仁Vamond3年前
081920
使用Aspera高速下载ngs数据并进行MD5校验-香草杏仁

使用Aspera高速下载ngs数据并进行MD5校验

因为课题研究需要结合参考一篇已发表的单细胞数据,由于该文章只提供的原始fastq文件,所有要下载下来从上游分析开始做起。(如果是是做数据库生信挖掘的也需要下载文件哦)一开始尝试的使用htt...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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EHJ:Lumican通过H3组蛋白乳酸化促进CAVD-香草杏仁

EHJ:Lumican通过H3组蛋白乳酸化促进CAVD

本研究探讨了Lumican(LUM)在钙化主动脉瓣病(CAVD)中的作用。通过单细胞RNA测序分析发现,LUM在VICs的转变中发挥关键作用,并促进H3组蛋白乳酸化,进而加速钙化过程。去除LUM可改善钙化情况...
离心分离技术-香草杏仁

离心分离技术

离心分离技术 离心技术的基本概念 利用溶液中颗粒密度、大小等特性,用旋转产生的离心力使不同特性颗粒在溶液中分离并沉降,从而达到分离、浓缩、 提纯的目的,称为离心技术。 离心分离三要素:...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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🌟立即升级你的链接!打造个性化艺术二维码!-香草杏仁

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