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细胞聚类的质控-HBC lesson 8-香草杏仁

细胞聚类的质控-HBC lesson 8

学习内容 评估是否存在聚类的假象 用PCA和UMAP图来确定聚类的质量,并了解何时需要重新聚类 评估已知的细胞类型标志物以假设集群的细胞类型身份 目标 确定集群是否代表真正的细胞类型或由于生物...
QC(质控)-HBC lesson 4-香草杏仁

QC(质控)-HBC lesson 4

QC(质控)-HBC lesson 4 在这一章你将会学到: 构建质控指标并使用相关图像可视化数据质量 估算质控指标并设置阈值去除低质量的细胞 单细胞数据分析流程的每个步骤都有这自己的目标和挑战。对...
Resistin: Potential biomarker and therapeutic target in atherosclerosis-香草杏仁

Resistin: Potential biomarker and therapeutic target in atherosclerosis

Zhou, Li, Jun-Yi Li, Ping-Ping He, Xiao-Hua Yu, and Chao-Ke Tang. “Resistin: Potential Biomarker and Therapeutic Target in Atherosclerosis.” Clinica Chimica Acta; International J...
激光扫描共聚焦显微镜和超高分辨率显微镜-香草杏仁

激光扫描共聚焦显微镜和超高分辨率显微镜

分子标记物:荧光素 Fluophore 能够吸收能量并在释放能量的过程中发光,吸收短波长的能量后发射出长波长的光。当激发照射停止,发射光也消失 。荧光素都需要知道2个波长: 激发光波长(excitati...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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从原始数据到表达矩阵-HBC lesson 2-香草杏仁

从原始数据到表达矩阵-HBC lesson 2

根据所使用的建库方法,单细胞的RNA序列(也称为读取(reads)或标签(tags))将从转录本的3'端(或5'端)(10X Genomics,CEL-seq2,Drop-seq,inDrops)或全长转录本(Smart-seq)获得。 参...