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Aspera批量下载fastq或sra文件（EBI数据库）
本文介绍了如何通过Aspera工具批量下载EBI数据库中的fastq或sra文件。首先，用户需通过conda创建一个新的环境并安装Aspera CLI和sra-tools。在获取到目标文件的下载链接后，可以使用Aspera命令...
9个月前
分析准备与读取数据-HBC lesson 3
本篇教程将会帮助你理解如何获得单细胞RNA测序实验中的数据。 基因表达定量完成之后，我们需要将这些数据导入R中，以生成可用于执行质控的矩阵。在本课中，我们将讨论计数数据可被导入的格式，...
5年前
细胞工程
核酸导入技术 将特异的核酸(DNA或RNA)导入到真核细胞中 ，以研究蛋白特性、调控基因表达、调节细胞行为等 常用的核酸导入方法 化学方法：构建非病毒载体（脂质体、DEAE-葡聚糖法、磷酸钙法导入...
5年前
EHJ：活化的血小板促进成骨并推动钙化性主动脉瓣狭窄的进展
本研究探讨了活化血小板对钙化性主动脉瓣狭窄（CAVS）进展的影响。结果显示，活化血小板通过分泌ADP促进心脏瓣膜间质细胞（VICs）的成骨程序，进一步导致钙化。研究利用多种技术（如SEM、免疫荧...
4年前.rds和.Rdata
.rds和.Rdata （也称为.rda ）文件都可用于以R本机格式存储R对象。与非本机存储方法（例如write.table相比，保存此方法有多个优点： 1)将数据恢复到R更快 2)它保持在数据中编码的R特定信息（例...
5年前细胞生物学技术考前参考
核心重点（非官方） 选择题 高严格度条件 不同离心方法的适用性 沉降系数、离心力与什么因素有关？ 转录因子重编程 检测细胞增殖或凋亡的手段及检测方法 流式的几个对照组 名词解释 透射电子与...
5年前windows R 内存管理
在做单细胞数据分析的时候习惯生成和保存很多中间变量，以便于debug的时候方便直接读取某一个中间变量进行后续分析。这些变量包括很多seurat object，对于多样本整合的数据来讲最后会很大，每次...
5年前
NC文章：磁性纳米颗粒靶向给药缓解瓣膜钙化
本研究通过靶向PAR2的磁性纳米颗粒，实现了针对主动脉瓣钙化的靶向药物递送系统。研究发现PAR2在成骨细胞中高表达，并促进瓣膜钙化，针对PAR2阳性细胞的干预可抑制瓣膜钙化的发展。利用功能化的...
2年前
关于“数据的维度”(dims参数)的选择
关于“数据的维度”(dims参数)的选择 Created time: Apr 13, 2021 12:07 PM Tags: R, Seurat, scRNA-seq 完成PCA之后，我们获得了该数据集的所有主成分（PCs）信息，但是如何决定纳入多少个主成...
5年前
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最新评论
啦噜噜7个月前0
发现宝藏miaomiaomiao3年前0
回顾一下LBL3年前0
不错👍KT3年前0
汝甚秀，吾不及汝LBL3年前0
太强了 优秀KT3年前0
确实xmq3年前0
太棒了，之前用的等候回答卡的要死，还动不动显示error，这个真的反应很快！xmq3年前0
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