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Midkine Prevents Calcification of Aortic Valve Interstitial Cells via Intercellular Crosstalk.-香草杏仁

Midkine Prevents Calcification of Aortic Valve Interstitial Cells via Intercellular Crosstalk.

Midkine Prevents Calcification of Aortic Valve Interstitial Cells via Intercellular Crosstalk. Zhou Q, Cao H, Hang X, Liang H, Zhu M, Fan Y, Shi J, Dong N, He X. Midkine Prevents C...
ubuntu 设置自动挂载磁盘-香草杏仁

ubuntu 设置自动挂载磁盘

系统:ubuntu20.04 创建挂载目录 sudo mkdir /mnt/data 磁盘查看磁盘信息 # 列出磁盘 lsblk # 查看磁盘UUID sudo blkid ### 输出中找到自己想挂载的磁盘,比如下面这个 ### /dev/sda1: LABEL='d...

.rds和.Rdata

.rds和.Rdata (也称为.rda )文件都可用于以R本机格式存储R对象。与非本机存储方法(例如write.table相比,保存此方法有多个优点: 1)将数据恢复到R更快 2)它保持在数据中编码的R特定信息(例...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
050910
单细胞聚类resolution参数的选择-香草杏仁

单细胞聚类resolution参数的选择

在进行细胞聚类时有两个参数的选择对下游分析的结果影响很大 一个是纳入分析的PCs数,也就是dims参数,选择方法见 关于“数据的维度”(dims参数)的选择 ; 另一个是resolution参数,官方推荐根...
linux常用命令:tar-香草杏仁

linux常用命令:tar

​​ Linux tar(英文全拼:tape archive )命令用于备份文件。 ​tar​是用来建立,还原备份文件的工具程序,它可以加入,解开备份文件内的文件。 备份文件不完全等同于压缩文件,linux中的备...
归一化并去除不需要的变异-HBC lesson 6.1-香草杏仁

归一化并去除不需要的变异-HBC lesson 6.1

在我们可以聚类细胞并识别不同的潜在细胞类型之前,我们还有几个步骤。我们的数据集有两个样本来自两个不同的条件(控制和刺激),所以整合这些样本,以更好地进行比较可能是有帮助的。我们需要...
scRNA-seq数据整合Introduction-香草杏仁

scRNA-seq数据整合Introduction

Seurat不仅可以校正实验的批次效应,还能跨平台整合数据,例如将10x单细胞数据、BD单细胞数据和SMART单细胞数据整合在一起;也能整合单细胞多组学数据,例如将单细胞ATAC、空间转录组与单细胞转...
蛋白质-蛋白质相互作用-香草杏仁

蛋白质-蛋白质相互作用

酵母双杂交(yeast two-hybrid) 酵母双杂交系统是在真核模式生物酵母中进行的,研究活细胞内蛋白质相互作用,是一种具有很高灵敏度的研究蛋白质之间关系的技术。 当我们将已知基因编码的蛋白作...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
053580
Rtools安装-香草杏仁

Rtools安装

出现的问题 最近在学习R语言得过程中,安装了最新版的R4.0.1和R Studio,但安装包的时候出现了下面的warning: WARNING: Rtools is required to build R packages but is not currently installe...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
053630
Seurat基本分析流程-香草杏仁

Seurat基本分析流程

参考链接: https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial.html 建立 Seurat 对象 示例数据为10X Genomics的外周血单个核细胞(PBMC)数据集,含有2700个单细胞,使用Illumina NextSeq...