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通过注释文件计算线粒体序列比例-香草杏仁

通过注释文件计算线粒体序列比例

经验证,人类样本的单细胞分析使用seurat教程的方法计算线粒体序列比例与此方法结果一致,但对于其他物种,建议使用此方法。 使用注释文件生成线粒体计数指标 我们将使用AnnotationHub,它允许...
电镜技术-香草杏仁

电镜技术

电镜技术 电子显微镜以电子射线作为照明光源,以电磁场作为透镜,具有高分辨率和放大倍率的显微镜。电镜用于研究组织和细胞的超微结构。 电子与样品作用后产生的电子信号主要有:透射电子和二次...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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归一化并去除不需要的变异-HBC lesson 6.1-香草杏仁

归一化并去除不需要的变异-HBC lesson 6.1

在我们可以聚类细胞并识别不同的潜在细胞类型之前,我们还有几个步骤。我们的数据集有两个样本来自两个不同的条件(控制和刺激),所以整合这些样本,以更好地进行比较可能是有帮助的。我们需要...

细胞生物学技术考前参考

核心重点(非官方) 选择题 高严格度条件 不同离心方法的适用性 沉降系数、离心力与什么因素有关? 转录因子重编程 检测细胞增殖或凋亡的手段及检测方法 流式的几个对照组 名词解释 透射电子与...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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MJ绘画基础教程--part1 🎨文生图的创作流程参考-香草杏仁

MJ绘画基础教程–part1 🎨文生图的创作流程参考

本文介绍了使用文生图进行绘画的流程,包括输入描述词、选择AI模型、设置尺寸、添加参考图、选择参数等步骤。同时提到了混合图片的方法和咒语解析过程,全面指导新手如何利用文生图进行创作。
Vamond的头像-香草杏仁Vamond2年前
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单细胞聚类resolution参数的选择-香草杏仁

单细胞聚类resolution参数的选择

在进行细胞聚类时有两个参数的选择对下游分析的结果影响很大 一个是纳入分析的PCs数,也就是dims参数,选择方法见 关于“数据的维度”(dims参数)的选择 ; 另一个是resolution参数,官方推荐根...
linux常用命令:tar-香草杏仁

linux常用命令:tar

​​ Linux tar(英文全拼:tape archive )命令用于备份文件。 ​tar​是用来建立,还原备份文件的工具程序,它可以加入,解开备份文件内的文件。 备份文件不完全等同于压缩文件,linux中的备...
Rtools安装-香草杏仁

Rtools安装

出现的问题 最近在学习R语言得过程中,安装了最新版的R4.0.1和R Studio,但安装包的时候出现了下面的warning: WARNING: Rtools is required to build R packages but is not currently installe...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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EHJ:活化的血小板促进成骨并推动钙化性主动脉瓣狭窄的进展-香草杏仁

EHJ:活化的血小板促进成骨并推动钙化性主动脉瓣狭窄的进展

本研究探讨了活化血小板对钙化性主动脉瓣狭窄(CAVS)进展的影响。结果显示,活化血小板通过分泌ADP促进心脏瓣膜间质细胞(VICs)的成骨程序,进一步导致钙化。研究利用多种技术(如SEM、免疫荧...
.rds和.Rdata(.rda)-香草杏仁

.rds和.Rdata(.rda)

​​ ​.rds​和.Rdata​ (也称为.rda​ )文件都可用于以R本机格式存储R对象。与非本机存储方法(例如write.table相比,保存此方法有多个优点: 1)将数据恢复到R更快 2)它保持在数据中编码的R...