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激光扫描共聚焦显微镜和超高分辨率显微镜-香草杏仁

激光扫描共聚焦显微镜和超高分辨率显微镜

分子标记物:荧光素 Fluophore 能够吸收能量并在释放能量的过程中发光,吸收短波长的能量后发射出长波长的光。当激发照射停止,发射光也消失 。荧光素都需要知道2个波长: 激发光波长(excitati...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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归一化并去除不需要的变异-HBC lesson 6.1-香草杏仁

归一化并去除不需要的变异-HBC lesson 6.1

在我们可以聚类细胞并识别不同的潜在细胞类型之前,我们还有几个步骤。我们的数据集有两个样本来自两个不同的条件(控制和刺激),所以整合这些样本,以更好地进行比较可能是有帮助的。我们需要...
.rds和.Rdata(.rda)-香草杏仁

.rds和.Rdata(.rda)

​​ ​.rds​和.Rdata​ (也称为.rda​ )文件都可用于以R本机格式存储R对象。与非本机存储方法(例如write.table相比,保存此方法有多个优点: 1)将数据恢复到R更快 2)它保持在数据中编码的R...
分析准备与读取数据-HBC lesson 3-香草杏仁

分析准备与读取数据-HBC lesson 3

本篇教程将会帮助你理解如何获得单细胞RNA测序实验中的数据。 基因表达定量完成之后,我们需要将这些数据导入R中,以生成可用于执行质控的矩阵。在本课中,我们将讨论计数数据可被导入的格式,...

.rds和.Rdata

.rds和.Rdata (也称为.rda )文件都可用于以R本机格式存储R对象。与非本机存储方法(例如write.table相比,保存此方法有多个优点: 1)将数据恢复到R更快 2)它保持在数据中编码的R特定信息(例...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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scRNA-seq简介-HBC lesson 1-香草杏仁

scRNA-seq简介-HBC lesson 1

参考链接: https://github.com/hbctraining/scRNA-seq_online/blob/master/lessons/01_intro_to_scRNA-seq.md 我们为什么需要单细胞RNA测序 人类各种组织之间细胞的类型,状态和相互作用差异巨...
使用singleR预测细胞类型-香草杏仁

使用singleR预测细胞类型

SingleR是用于单细胞RNA测序(scRNAseq)数据的自动注释方法(Aran et al.2019)。给定具有已知标签的样本(单细胞或RNAseq)参考数据集,它将基于与参考数据的相似性标记测试数据集中的新细胞...
ATVB:多组学揭示CAVD基质细胞状态变化与INHBA相关重塑-香草杏仁

ATVB:多组学揭示CAVD基质细胞状态变化与INHBA相关重塑

该研究整合胎儿、健康参照和钙化主动脉瓣单细胞图谱,并结合GWAS、bulk RNA-seq及体外功能实验,发现CAVD中炎症相关VDSC1和VDSC3显著扩增,遗传与疾病转录信号共同定位于VDSC,并筛出INHBA。敲...
MJ绘画基础教程--part3📚常用参数详解-香草杏仁

MJ绘画基础教程–part3📚常用参数详解

本文介绍了在使用MJ绘画基础教程中常用的参数,包括图片尺寸、创意程度、风格化程度、Seed种子、负向参数和参考图权重等。通过调整这些参数,可以控制生成图片的效果,提升创作灵活性和艺术性。
Vamond的头像-香草杏仁Vamond2年前
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