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生信分析环境搭建--conda+jupyter-香草杏仁

生信分析环境搭建–conda+jupyter

本文介绍了如何使用conda和jupyter notebook搭建生信分析环境,包括安装配置conda、jupyter notebook、scanpy等工具,并演示了在jupyter notebook中调用不同环境的方法。
Maturation of heart valve cell populations during postnatal remodeling-香草杏仁

Maturation of heart valve cell populations during postnatal remodeling

Maturation of heart valve cell populations during postnatal remodeling Article type: Original Article Institute: The Heart Institute, Division of Molecular Cardiovascular Biology, ...
安装omicverse docker版-香草杏仁

安装omicverse docker版

本文介绍了如何在Linux系统上安装Omicverse的Docker版本。Omicverse是一个基于Python的高通量测序数据分析框架,具有统一输入输出和改进的可视化功能。作者首先尝试通过conda和pip方式安装,但...
流式细胞术简介-香草杏仁

流式细胞术简介

流式细胞术(Flow Cytometry,FCM,FACS)是以流式细胞仪为检测手段的一项能快速、精确的对单个细胞(或生物学颗粒)的理化特性进行多参数定量分析和分选的技术。 流式细胞仪的结构和原理 分析型...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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细胞工程-香草杏仁

细胞工程

核酸导入技术 将特异的核酸(DNA或RNA)导入到真核细胞中 ,以研究蛋白特性、调控基因表达、调节细胞行为等 常用的核酸导入方法 化学方法:构建非病毒载体(脂质体、DEAE-葡聚糖法、磷酸钙法导入...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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生信分析环境配置:conda-香草杏仁

生信分析环境配置:conda

最近由于CPU、内存等降价明显,自己配了一台洋垃圾,双路E5-2696V3, 36核72线程+128G内存,用来学习linux系统和生信分析,自己用目前是足够了,后续如果需求提高了可以升级到256G内存,目前一套...
蛋白质-蛋白质相互作用-香草杏仁

蛋白质-蛋白质相互作用

酵母双杂交(yeast two-hybrid) 酵母双杂交系统是在真核模式生物酵母中进行的,研究活细胞内蛋白质相互作用,是一种具有很高灵敏度的研究蛋白质之间关系的技术。 当我们将已知基因编码的蛋白作...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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cellranger count 流程-香草杏仁

cellranger count 流程

准备工作:下载参考基因组和数据集 下载参考基因组 # 新建一个ref文件夹存放参考基因组 cd yard mkdir ref cd ref # 下载human GRCH38,大约11G wget https://cf.10xgenomics.com/supp/cell-exp...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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Ubuntu防火墙配置-香草杏仁

Ubuntu防火墙配置

Created time: December 22, 2021 7:49 PM 参考链接: https://blog.csdn.net/willingtolove/article/details/109863064 ​​ Ubuntu系统默认是安装了ufw防火墙的。查看防火墙的状态: sudo ufw ...
MJ绘画基础教程--part2🖌️生图之后的进一步操作-香草杏仁

MJ绘画基础教程–part2🖌️生图之后的进一步操作

本文介绍了在MJ绘画基础教程中,针对生图进行进一步操作的方法,包括单张放大、微调、倍数放大、图像变化、细化局部、拓展和平移等技术。通过这些操作,可以对图片进行精细处理和扩展,以达到更...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond2年前
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