学习内容 学会选择合适的PCs用于聚类分析 聚类的方法 目标 产生细胞类型特异性聚类，并使用已知的细胞类型标记基因来确定聚类的身份。 确定集群是否代表真正的细胞类型或由于生物或技术差异而产...

本文介绍了在使用MJ绘画基础教程中常用的参数，包括图片尺寸、创意程度、风格化程度、Seed种子、负向参数和参考图权重等。通过调整这些参数，可以控制生成图片的效果，提升创作灵活性和艺术性。

本篇教程将会帮助你理解如何获得单细胞RNA测序实验中的数据。 基因表达定量完成之后，我们需要将这些数据导入R中，以生成可用于执行质控的矩阵。在本课中，我们将讨论计数数据可被导入的格式，...

本研究旨在探讨二叶式主动脉瓣（BAV）的基因组和转录组学特征，以揭示其遗传机制。BAV 是一种常见的先天性心脏缺陷，尽管其遗传性较强，但目前已知的单基因突变仅能解释部分病例。为了解决这一...

流式细胞术（Flow Cytometry，FCM，FACS）是以流式细胞仪为检测手段的一项能快速、精确的对单个细胞(或生物学颗粒)的理化特性进行多参数定量分析和分选的技术。 流式细胞仪的结构和原理 分析型...

"Linux笔记" ubuntu ​​ 在用户主目录下有一个 .bashrc 隐藏文件，可以在此文件中加入 PATH 的设置如下： sudo vim ~/.bashrc 加入： export PATH=<你的要加入的路径>:$PATH e...

Seurat不仅可以校正实验的批次效应，还能跨平台整合数据，例如将10x单细胞数据、BD单细胞数据和SMART单细胞数据整合在一起；也能整合单细胞多组学数据，例如将单细胞ATAC、空间转录组与单细胞转...

在进行细胞聚类时有两个参数的选择对下游分析的结果影响很大 一个是纳入分析的PCs数，也就是dims参数，选择方法见 关于“数据的维度”(dims参数)的选择 ； 另一个是resolution参数，官方推荐根...

准备工作：下载参考基因组和数据集 下载参考基因组 # 新建一个ref文件夹存放参考基因组 cd yard mkdir ref cd ref # 下载human GRCH38，大约11G wget https://cf.10xgenomics.com/supp/cell-exp...