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Seurat安装
从CRAN安装最新版 4.0+seurat需要R也是4.0+的版本 Seurat is available on CRAN for all platforms. To install, run: # Enter commands in R (or R studio, if installed) install.packages(&#...
5年前
分析准备与读取数据-HBC lesson 3
本篇教程将会帮助你理解如何获得单细胞RNA测序实验中的数据。 基因表达定量完成之后，我们需要将这些数据导入R中，以生成可用于执行质控的矩阵。在本课中，我们将讨论计数数据可被导入的格式，...
5年前
使用singleR预测细胞类型
SingleR是用于单细胞RNA测序（scRNAseq）数据的自动注释方法（Aran et al.2019）。给定具有已知标签的样本（单细胞或RNAseq）参考数据集，它将基于与参考数据的相似性标记测试数据集中的新细胞...
5年前
linux中的usr和bin目录
首先注意 usr 指 Unix System Resource，而不是user /usr/bin：系统预装的一些可执行程序，随系统升级会改变 /usr/local/bin：用户安装的可执行程序，不受系统升级影响，用户编译...
3年前
本地部署Deepseek-R1+知识库构建
本文介绍了在本地部署Deepseek-R1模型并构建知识库的步骤，主要分为五个部分。首先，用户需要安装Ollama软件，并通过命令行下载所需的模型。接着，通过访问指定的本地端口，可以在浏览器中查看...
1年前
linux常用命令：tar
Linux tar（英文全拼：tape archive ）命令用于备份文件。 tar是用来建立，还原备份文件的工具程序，它可以加入，解开备份文件内的文件。 备份文件不完全等同于压缩文件，linux中的备...
3年前
细胞培养基及添加剂的一些知识
培养基的基本成分 血清 血清是白蛋白、生长因子和生长抑制剂的复杂混合物，可能是细胞培养基中最重要的成分之一。最常用的血清是胎牛血清（FBS）。其他可用的血清类型包括新生小牛血清和马血清...
5年前
支持linux平台的截图神器flameshot
前言 最近在学习单细胞转录组的上游分析，不得已安装了ubuntu18.04系统，第一次使用linux，怪不习惯的，而且很多在win10平台下很方便的功能在linux下找到替代会稍微费点精力。 比如我习惯后台跑...
5年前
Seurat基本分析流程
参考链接: https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial.html 建立 Seurat 对象 示例数据为10X Genomics的外周血单个核细胞（PBMC）数据集，含有2700个单细胞，使用Illumina NextSeq...
5年前细胞生物学技术考前参考
核心重点（非官方） 选择题 高严格度条件 不同离心方法的适用性 沉降系数、离心力与什么因素有关？ 转录因子重编程 检测细胞增殖或凋亡的手段及检测方法 流式的几个对照组 名词解释 透射电子与...
5年前
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最新评论
啦噜噜1年前0
发现宝藏miaomiaomiao3年前0
回顾一下LBL3年前0
不错👍KT3年前0
汝甚秀，吾不及汝LBL3年前0
太强了 优秀KT3年前0
确实xmq3年前0
太棒了，之前用的等候回答卡的要死，还动不动显示error，这个真的反应很快！xmq3年前0
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