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关于“数据的维度”(dims参数)的选择-香草杏仁

关于“数据的维度”(dims参数)的选择

关于“数据的维度”(dims参数)的选择 Created time: Apr 13, 2021 12:07 PM Tags: R, Seurat, scRNA-seq 完成PCA之后,我们获得了该数据集的所有主成分(PCs)信息,但是如何决定纳入多少个主成...
本地部署Deepseek-R1+知识库构建-香草杏仁

本地部署Deepseek-R1+知识库构建

本文介绍了在本地部署Deepseek-R1模型并构建知识库的步骤,主要分为五个部分。首先,用户需要安装Ollama软件,并通过命令行下载所需的模型。接着,通过访问指定的本地端口,可以在浏览器中查看...
scRNA-seq数据整合Introduction-香草杏仁

scRNA-seq数据整合Introduction

Seurat不仅可以校正实验的批次效应,还能跨平台整合数据,例如将10x单细胞数据、BD单细胞数据和SMART单细胞数据整合在一起;也能整合单细胞多组学数据,例如将单细胞ATAC、空间转录组与单细胞转...
Maturation of heart valve cell populations during postnatal remodeling-香草杏仁

Maturation of heart valve cell populations during postnatal remodeling

Maturation of heart valve cell populations during postnatal remodeling Article type: Original Article Institute: The Heart Institute, Division of Molecular Cardiovascular Biology, ...
Rtools安装-香草杏仁

Rtools安装

出现的问题 最近在学习R语言得过程中,安装了最新版的R4.0.1和R Studio,但安装包的时候出现了下面的warning: WARNING: Rtools is required to build R packages but is not currently installe...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond5年前
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linux常用命令: systemctl-香草杏仁

linux常用命令: systemctl

​​ linux系统结构/lib/systemd/system​目录 根据 Linux 惯例,字母d​是守护进程(daemon)的缩写。 Systemd 这个名字的含义,就是它要守护整个系统。 该目录自动存放启动文件的配置位置,里...
归一化与主成分分析-HBC lesson 5-香草杏仁

归一化与主成分分析-HBC lesson 5

在我们我们获得高质量的单细胞数据后,单细胞RNA测序分析工作流程的下一步是进行聚类。聚类的目标是将不同的细胞类型分离成独特的细胞群。为了执行聚类,我们需要确定细胞间表达差异最大的基因...
聚类分析-HBC lesson 7-香草杏仁

聚类分析-HBC lesson 7

学习内容 学会选择合适的PCs用于聚类分析 聚类的方法 目标 产生细胞类型特异性聚类,并使用已知的细胞类型标记基因来确定聚类的身份。 确定集群是否代表真正的细胞类型或由于生物或技术差异而产...
NC文章:磁性纳米颗粒靶向给药缓解瓣膜钙化-香草杏仁

NC文章:磁性纳米颗粒靶向给药缓解瓣膜钙化

本研究通过靶向PAR2的磁性纳米颗粒,实现了针对主动脉瓣钙化的靶向药物递送系统。研究发现PAR2在成骨细胞中高表达,并促进瓣膜钙化,针对PAR2阳性细胞的干预可抑制瓣膜钙化的发展。利用功能化的...