单细胞转录组代谢流分析软件COMPASS&MEBOCOST安装
本文详细记录了在Linux系统上安装COMPASS软件的过程，COMPASS是一款用于单细胞转录组代谢流分析的软件。首先，需要创建一个Python 3.9或3.10的conda环境，并确保pandas版本低于2.0.0。接着，安...
scRNA-seq简介-HBC lesson 1
参考链接: https://github.com/hbctraining/scRNA-seq_online/blob/master/lessons/01_intro_to_scRNA-seq.md 我们为什么需要单细胞RNA测序 人类各种组织之间细胞的类型，状态和相互作用差异巨...
CV Weekly Digest | 2026-03-03
本周高价值论文共同指向“细胞命运决定+微环境重塑”作为心血管疾病可干预主轴；对CAVD而言，优先把VIC表型转换与炎症/代谢/细胞器通讯做因果串联，将更容易产出可转化机制。 Source Agent: res...
Circulation：主动脉瓣钙化是由ALDH1A1的丧失引起的，并且可以通过视黄酸受体α的激动剂来预防
本研究探讨了主动脉瓣钙化的机制以及潜在的预防策略。研究发现，ALDH1A1基因在钙化的主动脉瓣膜中显著下调，其缺失可能促使瓣膜间质细胞向成骨样表型转变，从而加速钙化进程。此外，TGF-β1通过...
本地部署Deepseek-R1+知识库构建
本文介绍了在本地部署Deepseek-R1模型并构建知识库的步骤，主要分为五个部分。首先，用户需要安装Ollama软件，并通过命令行下载所需的模型。接着，通过访问指定的本地端口，可以在浏览器中查看...
CV Weekly Digest | 2026-05-18
本周证据形成三个相互衔接的层面：脂质组学将CAVD严重度与具体分子重塑直接关联；LTBP4–NLRP3研究提示机械后负荷可通过炎症与细胞内运输驱动心肌失代偿；单细胞图谱则展示了从细胞异质性发现到...
CV Weekly Digest | 2026-05-11
本周证据呈现出从病因机制到外科服务的连续链条：CROT研究把线粒体功能障碍、细胞外囊泡与瓣膜间质细胞钙化直接连接，是最具CAVD特异性的疾病修饰线索；MESA研究则从遗传层面支持Lp(a)、LDL-C和...
CV Weekly Digest | 2026-05-25
本周证据形成了从疾病负担、早期机制和实验模型到介入结局的连续链条。CAVD研究的关键机会仍在于解释脂质危险因素如何与流动感知、内皮应激和炎症协同，并将这些机制转化为可重复的主动脉根实验...
CV Weekly Digest | 2026-05-04
本周证据形成了从CAVD机制发现到主动脉瓣临床管理的连续视角：VDSC1-INHBA轴将人瓣膜细胞状态、免疫通讯与VIC钙化功能验证相连接，是最值得持续追踪的潜在治疗入口；临床研究则提示，主动脉瓣疾...
Basic Res Cardiol：二叶式主动脉瓣狭窄的血管生成、炎症与局部钙化特征
该研究结合终末期人主动脉瓣 bulk RNA-seq、Kawamoto 未脱钙组织学、micro-CT 与独立 TAVI 队列，比较二叶式和三叶式主动脉瓣狭窄。bAVS 呈现更广泛的血管生成、炎症和基质重塑相关转录改变，并...