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单细胞转录组代谢流分析软件COMPASS&MEBOCOST安装-香草杏仁

单细胞转录组代谢流分析软件COMPASS&MEBOCOST安装

本文详细记录了在Linux系统上安装COMPASS软件的过程,COMPASS是一款用于单细胞转录组代谢流分析的软件。首先,需要创建一个Python 3.9或3.10的conda环境,并确保pandas版本低于2.0.0。接着,安...
CV Weekly Digest | 2026-03-03-香草杏仁

CV Weekly Digest | 2026-03-03

本周高价值论文共同指向“细胞命运决定+微环境重塑”作为心血管疾病可干预主轴;对CAVD而言,优先把VIC表型转换与炎症/代谢/细胞器通讯做因果串联,将更容易产出可转化机制。 Source Agent: res...
scRNA-seq简介-HBC lesson 1-香草杏仁

scRNA-seq简介-HBC lesson 1

参考链接: https://github.com/hbctraining/scRNA-seq_online/blob/master/lessons/01_intro_to_scRNA-seq.md 我们为什么需要单细胞RNA测序 人类各种组织之间细胞的类型,状态和相互作用差异巨...
本地部署Deepseek-R1+知识库构建-香草杏仁

本地部署Deepseek-R1+知识库构建

本文介绍了在本地部署Deepseek-R1模型并构建知识库的步骤,主要分为五个部分。首先,用户需要安装Ollama软件,并通过命令行下载所需的模型。接着,通过访问指定的本地端口,可以在浏览器中查看...
Circulation:主动脉瓣钙化是由ALDH1A1的丧失引起的,并且可以通过视黄酸受体α的激动剂来预防-香草杏仁

Circulation:主动脉瓣钙化是由ALDH1A1的丧失引起的,并且可以通过视黄酸受体α的激动剂来预防

本研究探讨了主动脉瓣钙化的机制以及潜在的预防策略。研究发现,ALDH1A1基因在钙化的主动脉瓣膜中显著下调,其缺失可能促使瓣膜间质细胞向成骨样表型转变,从而加速钙化进程。此外,TGF-β1通过...
CV Weekly Digest | 2026-04-13-香草杏仁

CV Weekly Digest | 2026-04-13

本周窗口最清晰的信号,是“强机制基础论文 + 主动脉瓣临床分层/影像重构 + 可编程工程工具”三条线同时出现。对 CAVD/CV 研究最值得优先精读的仍是前两篇基础工作:一篇把微管谷氨酰化—spasti...
Nature Genetics:主动脉瓣功能及主动脉瓣狭窄风险相关遗传变异的多性状分析研究-香草杏仁

Nature Genetics:主动脉瓣功能及主动脉瓣狭窄风险相关遗传变异的多性状分析研究

本研究致力于探讨主动脉瓣功能及其与主动脉瓣狭窄(AS)风险相关的遗传变异。通过对UK Biobank中62902名参与者进行相差心血管磁共振成像(cMRI),结合深度学习技术,自动提取了三项关键的生理...
CV Weekly Digest | 2026-03-09-香草杏仁

CV Weekly Digest | 2026-03-09

本周最强的共通信号不是某一条孤立通路,而是代谢重编程、细胞状态转换、炎症/NETosis 与组织稳态失衡这四类机制正在不同心血管病中反复汇聚。对 CAVD 研究来说,这意味着下阶段最值得盯的是把 ...
CV Weekly Digest | 2026-03-16-香草杏仁

CV Weekly Digest | 2026-03-16

Source Agent: research 1. PRMT3-Mediated Arginine Methylation Stabilizes PCSK9 to Promote Aortic Valve Calcification Summary: 背景:CAVD 仍缺乏明确可药物化靶点。方法:研究结合患者...
CV Weekly Digest | 2026-03-23-香草杏仁

CV Weekly Digest | 2026-03-23

Expert viewpoint: 本周最强信号仍然是“衰老/代谢/炎症”这条上游生物学主线正在同时从主动脉瓣、纤维化、系统代谢和 CHIP 角度被不断加固;其中 CAVD 相关的衰老代谢重塑最值得优先跟进,因为...