生信分析环境搭建–conda+jupyter
本文介绍了如何使用conda和jupyter notebook搭建生信分析环境，包括安装配置conda、jupyter notebook、scanpy等工具，并演示了在jupyter notebook中调用不同环境的方法。
本地部署Deepseek-R1+知识库构建
本文介绍了在本地部署Deepseek-R1模型并构建知识库的步骤，主要分为五个部分。首先，用户需要安装Ollama软件，并通过命令行下载所需的模型。接着，通过访问指定的本地端口，可以在浏览器中查看...
安装omicverse docker版
本文介绍了如何在Linux系统上安装Omicverse的Docker版本。Omicverse是一个基于Python的高通量测序数据分析框架，具有统一输入输出和改进的可视化功能。作者首先尝试通过conda和pip方式安装，但...
Circulation: 靶向鞘氨醇-1-磷酸信号通路以防止主动脉瓣疾病的进展
本文探讨了鞘氨醇-1-磷酸（S1P）信号通路在主动脉瓣疾病（AVD）进展中的作用。研究显示，随着人口老龄化，AVD 在老年人群中日益普遍，现有的治疗手段主要限于瓣膜置换，缺乏有效的药物干预。本...
下载sra文件（多线程高速版） download_sra.sh
这篇文章介绍了一个多线程下载NCBI数据库中SRA文件的脚本download_sra.sh。使用前需要确认已安装sra-tools。该脚本通过prefetch命令，可以高效地下载各种SRA文件，包括bulk-seq和single cell原...
NC文章：FCAVD的性别特异性脂质组学特征
题目：Sex-specific lipidomic signatures in aortic valve disease reflect differential fibro-calcific progression期刊：Nature Communications（2025）DOI：10.1038/s41467-025-60411-2...
Circulation：二叶式主动脉瓣的基因组与转录组学研究
本研究旨在探讨二叶式主动脉瓣（BAV）的基因组和转录组学特征，以揭示其遗传机制。BAV 是一种常见的先天性心脏缺陷，尽管其遗传性较强，但目前已知的单基因突变仅能解释部分病例。为了解决这一...
CV Weekly Digest | 2026-03-09
本周最强的共通信号不是某一条孤立通路，而是代谢重编程、细胞状态转换、炎症/NETosis 与组织稳态失衡这四类机制正在不同心血管病中反复汇聚。对 CAVD 研究来说，这意味着下阶段最值得盯的是把 ...
ATVB：主动脉瓣狭窄的性别差异蛋白质组学
本文研究了钙化性主动脉瓣狭窄（AS）中血浆和组织蛋白质组的性别差异。通过LC-MS/ms技术，分析了32名男性和20名女性的血浆样本，发现20种循环蛋白在两性之间存在显著差异。男性的富集蛋白与急性...
CVR：FOXS1介导胆固醇转运失调驱动主动脉瓣钙化研究
本研究探讨了氧化低密度脂蛋白（oxLDL）诱导的转录因子FOXS1在钙化性主动脉瓣疾病（CAVD）中的作用。研究表明，oxLDL通过激活FOXS1导致胆固醇转运功能障碍，从而引发瓣膜间质细胞（VICs）的成骨...