WordPress搭建个人博客1——阿里云+LAMP+WordPress
记得当时中学的时候就开始希望自己能有一个网站,当时自己可能都不知道什么是博客,就是单纯觉得有一个个人网站是一个很酷的事情,那是一片属于自己的天地,但是以前门槛较高,中学时代也没啥时...
使用Aspera高速下载ngs数据并进行MD5校验
因为课题研究需要结合参考一篇已发表的单细胞数据,由于该文章只提供的原始fastq文件,所有要下载下来从上游分析开始做起。(如果是是做数据库生信挖掘的也需要下载文件哦)一开始尝试的使用htt...
cellranger count 流程
准备工作:下载参考基因组和数据集 下载参考基因组 # 新建一个ref文件夹存放参考基因组 cd yard mkdir ref cd ref # 下载human GRCH38,大约11G wget https://cf.10xgenomics.com/supp/cell-exp...
cellranger的安装
新建一个文件夹 打开linux终端,运行 mkdir yard 验证一下工作目录 pwd /home/vamond/yard 进入该目录,新建apps文件夹,用于存放cellreanger cd /mnt/home/user.name/yard mkdir apps cd apps ...
使用pheatmap可视化marker基因
在完成单细胞分析基本流程之后,我们获得了各个细胞聚类和相应的marker基因,有多种方式可以可视化marker基因的表达量,seurat包中自带的DoHeatmap()、VlnPlot()以及DotPlot()函数可以很方便的...