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windows R 内存管理-香草杏仁

windows R 内存管理

在做单细胞数据分析的时候习惯生成和保存很多中间变量,以便于debug的时候方便直接读取某一个中间变量进行后续分析。这些变量包括很多seurat object,对于多样本整合的数据来讲最后会很大,每次...
4年前
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使用pheatmap可视化marker基因-香草杏仁
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使用pheatmap可视化marker基因

在完成单细胞分析基本流程之后,我们获得了各个细胞聚类和相应的marker基因,有多种方式可以可视化marker基因的表达量,seurat包中自带的DoHeatmap()、VlnPlot()以及DotPlot()函数可以很方便的...
细胞培养基及添加剂的一些知识-香草杏仁

细胞培养基及添加剂的一些知识

培养基的基本成分 血清 血清是白蛋白、生长因子和生长抑制剂的复杂混合物,可能是细胞培养基中最重要的成分之一。最常用的血清是胎牛血清(FBS)。其他可用的血清类型包括新生小牛血清和马血清...
细胞生物学技术考前参考-香草杏仁

细胞生物学技术考前参考

核心重点(非官方) 选择题 高严格度条件 不同离心方法的适用性 沉降系数、离心力与什么因素有关? 转录因子重编程 检测细胞增殖或凋亡的手段及检测方法 流式的几个对照组 名词解释 透射电子与...
离心分离技术-香草杏仁

离心分离技术

离心分离技术 离心技术的基本概念 利用溶液中颗粒密度、大小等特性,用旋转产生的离心力使不同特性颗粒在溶液中分离并沉降,从而达到分离、浓缩、 提纯的目的,称为离心技术。 离心分离三要素:...
蛋白质-蛋白质相互作用-香草杏仁

蛋白质-蛋白质相互作用

酵母双杂交(yeast two-hybrid) 酵母双杂交系统是在真核模式生物酵母中进行的,研究活细胞内蛋白质相互作用,是一种具有很高灵敏度的研究蛋白质之间关系的技术。 当我们将已知基因编码的蛋白作...
蛋白质-核酸相互作用-香草杏仁

蛋白质-核酸相互作用

报告基因Assay 报告基因:是一种编码可被检测的蛋白质或酶的基因,也就是说,是一个其表达产物非常容易被鉴定的基因。把它的编码序列和基因表达调节序列相融合形成嵌合基因,或与其它目的基因相...
流式细胞术简介-香草杏仁

流式细胞术简介

流式细胞术(Flow Cytometry,FCM,FACS)是以流式细胞仪为检测手段的一项能快速、精确的对单个细胞(或生物学颗粒)的理化特性进行多参数定量分析和分选的技术。 流式细胞仪的结构和原理 分析型...
细胞培养的基本技术与知识-香草杏仁

细胞培养的基本技术与知识

基本技术 细胞的分离和原代培养 猪VICs的分离培养(以我自己使用的原代细胞为例) 将4-6月龄的猪使用丙泊酚诱导麻醉后,静脉注射氯化钾处死; 开胸后分离结扎主动脉、上腔静脉、下腔静脉,摘除...
细胞化学技术-香草杏仁

细胞化学技术

在保持细胞结构完整的条件下,借助细胞中的化学反应在细胞原位确定化学成分的分布、量及其在细胞活动中的动态变化的技术,达到定性、定位和相对定量的目的,用以阐明化学成分在细胞中的功能、与...