激光扫描共聚焦显微镜和超高分辨率显微镜
分子标记物:荧光素 Fluophore 能够吸收能量并在释放能量的过程中发光,吸收短波长的能量后发射出长波长的光。当激发照射停止,发射光也消失 。荧光素都需要知道2个波长: 激发光波长(excitati...
WordPress搭建个人博客1——阿里云+LAMP+WordPress
记得当时中学的时候就开始希望自己能有一个网站,当时自己可能都不知道什么是博客,就是单纯觉得有一个个人网站是一个很酷的事情,那是一片属于自己的天地,但是以前门槛较高,中学时代也没啥时...
支持linux平台的截图神器flameshot
前言 最近在学习单细胞转录组的上游分析,不得已安装了ubuntu18.04系统,第一次使用linux,怪不习惯的,而且很多在win10平台下很方便的功能在linux下找到替代会稍微费点精力。 比如我习惯后台跑...
使用Aspera高速下载ngs数据并进行MD5校验
因为课题研究需要结合参考一篇已发表的单细胞数据,由于该文章只提供的原始fastq文件,所有要下载下来从上游分析开始做起。(如果是是做数据库生信挖掘的也需要下载文件哦)一开始尝试的使用htt...
cellranger count 流程
准备工作:下载参考基因组和数据集 下载参考基因组 # 新建一个ref文件夹存放参考基因组 cd yard mkdir ref cd ref # 下载human GRCH38,大约11G wget https://cf.10xgenomics.com/supp/cell-exp...
cellranger的安装
新建一个文件夹 打开linux终端,运行 mkdir yard 验证一下工作目录 pwd /home/vamond/yard 进入该目录,新建apps文件夹,用于存放cellreanger cd /mnt/home/user.name/yard mkdir apps cd apps ...