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单细胞转录组代谢流分析软件COMPASS&MEBOCOST安装-香草杏仁

单细胞转录组代谢流分析软件COMPASS&MEBOCOST安装

本文详细记录了在Linux系统上安装COMPASS软件的过程,COMPASS是一款用于单细胞转录组代谢流分析的软件。首先,需要创建一个Python 3.9或3.10的conda环境,并确保pandas版本低于2.0.0。接着,安...
scRNA-seq简介-HBC lesson 1-香草杏仁

scRNA-seq简介-HBC lesson 1

参考链接: https://github.com/hbctraining/scRNA-seq_online/blob/master/lessons/01_intro_to_scRNA-seq.md 我们为什么需要单细胞RNA测序 人类各种组织之间细胞的类型,状态和相互作用差异巨...
本地部署Deepseek-R1+知识库构建-香草杏仁

本地部署Deepseek-R1+知识库构建

本文介绍了在本地部署Deepseek-R1模型并构建知识库的步骤,主要分为五个部分。首先,用户需要安装Ollama软件,并通过命令行下载所需的模型。接着,通过访问指定的本地端口,可以在浏览器中查看...
Circulation:主动脉瓣钙化是由ALDH1A1的丧失引起的,并且可以通过视黄酸受体α的激动剂来预防-香草杏仁

Circulation:主动脉瓣钙化是由ALDH1A1的丧失引起的,并且可以通过视黄酸受体α的激动剂来预防

本研究探讨了主动脉瓣钙化的机制以及潜在的预防策略。研究发现,ALDH1A1基因在钙化的主动脉瓣膜中显著下调,其缺失可能促使瓣膜间质细胞向成骨样表型转变,从而加速钙化进程。此外,TGF-β1通过...
CV Weekly Digest | 2026-03-03-香草杏仁

CV Weekly Digest | 2026-03-03

本周高价值论文共同指向“细胞命运决定+微环境重塑”作为心血管疾病可干预主轴;对CAVD而言,优先把VIC表型转换与炎症/代谢/细胞器通讯做因果串联,将更容易产出可转化机制。 Source Agent: res...
NC文章:FCAVD的性别特异性脂质组学特征-香草杏仁

NC文章:FCAVD的性别特异性脂质组学特征

 题目:Sex-specific lipidomic signatures in aortic valve disease reflect differential fibro-calcific progression期刊:Nature Communications(2025)DOI:10.1038/s41467-025-60411-2...
CV Weekly Digest | 2026-04-20-香草杏仁

CV Weekly Digest | 2026-04-20

本周候选池最强信号仍然落在动脉粥样硬化跨细胞通讯与心肌保护,而非直接的 CAVD/主动脉瓣基础研究。对我的主线最有迁移价值的是 miR-146a-5p 介导的免疫细胞到血管平滑肌细胞信号转移,这类跨...
CV Weekly Digest | 2026-04-13-香草杏仁

CV Weekly Digest | 2026-04-13

本周窗口最清晰的信号,是“强机制基础论文 + 主动脉瓣临床分层/影像重构 + 可编程工程工具”三条线同时出现。对 CAVD/CV 研究最值得优先精读的仍是前两篇基础工作:一篇把微管谷氨酰化—spasti...
CV Weekly Digest | 2026-04-06-香草杏仁

CV Weekly Digest | 2026-04-06

本周最值得追的信号有三条:其一,主动脉瓣/TAVR 方向目前新发文以流程优化和术后可达性为主,临床转化价值高,但真正“打机制核心”的瓣膜基础论文仍偏少;其二,低剪切力-P53/xCT-内皮 ferrop...
CV Weekly Digest | 2026-03-31-香草杏仁

CV Weekly Digest | 2026-03-31

Expert viewpoint: 本周窗口里最强的信号不是主动脉瓣本体论文爆发,而是“代谢/转录后调控机制 + 数字化风险分层 + 可执行预防策略”三条线同时变清楚。其中最值得优先精读的是 METTL14-PPAR-...