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单细胞转录组代谢流分析软件COMPASS&MEBOCOST安装-香草杏仁

单细胞转录组代谢流分析软件COMPASS&MEBOCOST安装

本文详细记录了在Linux系统上安装COMPASS软件的过程,COMPASS是一款用于单细胞转录组代谢流分析的软件。首先,需要创建一个Python 3.9或3.10的conda环境,并确保pandas版本低于2.0.0。接着,安...
scRNA-seq简介-HBC lesson 1-香草杏仁

scRNA-seq简介-HBC lesson 1

参考链接: https://github.com/hbctraining/scRNA-seq_online/blob/master/lessons/01_intro_to_scRNA-seq.md 我们为什么需要单细胞RNA测序 人类各种组织之间细胞的类型,状态和相互作用差异巨...
本地部署Deepseek-R1+知识库构建-香草杏仁

本地部署Deepseek-R1+知识库构建

本文介绍了在本地部署Deepseek-R1模型并构建知识库的步骤,主要分为五个部分。首先,用户需要安装Ollama软件,并通过命令行下载所需的模型。接着,通过访问指定的本地端口,可以在浏览器中查看...
Circulation:主动脉瓣钙化是由ALDH1A1的丧失引起的,并且可以通过视黄酸受体α的激动剂来预防-香草杏仁

Circulation:主动脉瓣钙化是由ALDH1A1的丧失引起的,并且可以通过视黄酸受体α的激动剂来预防

本研究探讨了主动脉瓣钙化的机制以及潜在的预防策略。研究发现,ALDH1A1基因在钙化的主动脉瓣膜中显著下调,其缺失可能促使瓣膜间质细胞向成骨样表型转变,从而加速钙化进程。此外,TGF-β1通过...
CV Weekly Digest | 2026-03-03-香草杏仁

CV Weekly Digest | 2026-03-03

本周高价值论文共同指向“细胞命运决定+微环境重塑”作为心血管疾病可干预主轴;对CAVD而言,优先把VIC表型转换与炎症/代谢/细胞器通讯做因果串联,将更容易产出可转化机制。 Source Agent: res...
CV Weekly Digest | 2026-06-15-香草杏仁

CV Weekly Digest | 2026-06-15

本期证据勾勒出CAVD从瓣膜干预到心肌结局的连续链条:TAVI后扩张研究强调机械优化必须同时控制传导损伤;CASQ2研究提示钙稳态异常与成骨样细胞转换可能构成可跨主动脉壁和瓣膜验证的机制;SRPK3...
CV Weekly Digest | 2026-07-27-香草杏仁

CV Weekly Digest | 2026-07-27

本周证据呈现出从瓣膜病因、压力负荷性心肌损伤到干预后终身管理的连续链条。S1PR2-NLRP3炎症轴与SERCA2a钙稳态研究提示,CAVD结局不仅取决于解除瓣膜梗阻,也取决于心肌炎症、线粒体质量控制和...
CV Weekly Digest | 2026-08-03-香草杏仁

CV Weekly Digest | 2026-08-03

本周最具直接临床价值的两项研究分别聚焦TAVR后瓣周反流的侵入性血流动力学分层,以及TAVI合并冠心病时PCI获益人群的识别,共同指向更精细的围瓣膜治疗决策。三项基础与转化研究则从细胞外囊泡...
CV Weekly Digest | 2026-08-10-香草杏仁

CV Weekly Digest | 2026-08-10

本周证据形成从机制校准、心肌易损性到主动脉瓣风险分层和治疗选择的连续链条。临床研究一致提示,主动脉瓣病管理不宜局限于狭窄分级或传统左室阈值:合并反流、左房功能及患者年龄和耐久性需求...
ATVB:多组学揭示CAVD基质细胞状态变化与INHBA相关重塑-香草杏仁

ATVB:多组学揭示CAVD基质细胞状态变化与INHBA相关重塑

该研究整合胎儿、健康参照和钙化主动脉瓣单细胞图谱,并结合GWAS、bulk RNA-seq及体外功能实验,发现CAVD中炎症相关VDSC1和VDSC3显著扩增,遗传与疾病转录信号共同定位于VDSC,并筛出INHBA。敲...