关于“数据的维度”(dims参数)的选择
关于“数据的维度”(dims参数)的选择 Created time: Apr 13, 2021 12:07 PM Tags: R, Seurat, scRNA-seq 完成PCA之后，我们获得了该数据集的所有主成分（PCs）信息，但是如何决定纳入多少个主成...
Rtools安装
出现的问题 最近在学习R语言得过程中，安装了最新版的R4.0.1和R Studio，但安装包的时候出现了下面的warning: WARNING: Rtools is required to build R packages but is not currently installe...
Seurat基本分析流程
参考链接: https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial.html 建立 Seurat 对象 示例数据为10X Genomics的外周血单个核细胞（PBMC）数据集，含有2700个单细胞，使用Illumina NextSeq...
激光扫描共聚焦显微镜和超高分辨率显微镜
分子标记物：荧光素 Fluophore 能够吸收能量并在释放能量的过程中发光，吸收短波长的能量后发射出长波长的光。当激发照射停止，发射光也消失 。荧光素都需要知道2个波长： 激发光波长（excitati...
Seurat安装
从CRAN安装最新版 4.0+seurat需要R也是4.0+的版本 Seurat is available on CRAN for all platforms. To install, run: # Enter commands in R (or R studio, if installed) install.packages(&#...
Midkine Prevents Calcification of Aortic Valve Interstitial Cells via Intercellular Crosstalk.
Midkine Prevents Calcification of Aortic Valve Interstitial Cells via Intercellular Crosstalk. Zhou Q, Cao H, Hang X, Liang H, Zhu M, Fan Y, Shi J, Dong N, He X. Midkine Prevents C...
简单5步设计qPCR引物
对于研究比较多的分子，我们需要引物的时候可以很方便的在文献中找到别人用过的，或者在primerbank中查到相应的引物序列，然后通过比对和预实验验证选择合适的引物。但有时候我们研究的分子引物...
细胞生物学技术考前参考
核心重点（非官方） 选择题 高严格度条件 不同离心方法的适用性 沉降系数、离心力与什么因素有关？ 转录因子重编程 检测细胞增殖或凋亡的手段及检测方法 流式的几个对照组 名词解释 透射电子与...
蛋白质-蛋白质相互作用
酵母双杂交（yeast two-hybrid） 酵母双杂交系统是在真核模式生物酵母中进行的，研究活细胞内蛋白质相互作用，是一种具有很高灵敏度的研究蛋白质之间关系的技术。 当我们将已知基因编码的蛋白作...
蛋白质-核酸相互作用
报告基因Assay 报告基因：是一种编码可被检测的蛋白质或酶的基因，也就是说，是一个其表达产物非常容易被鉴定的基因。把它的编码序列和基因表达调节序列相融合形成嵌合基因，或与其它目的基因相...