单细胞共3篇
学习单细胞分析过程中的一些笔记,多数来自网络已有教程,我记录了一下自己的学习过程,并且整理在此,以供后续参考。
单细胞转录组代谢流分析软件COMPASS安装-香草杏仁

单细胞转录组代谢流分析软件COMPASS安装

本文详细记录了在Linux系统上安装COMPASS软件的过程,COMPASS是一款用于单细胞转录组代谢流分析的软件。首先,需要创建一个Python 3.9或3.10的conda环境,并确保pandas版本低于2.0.0。接着,安...
Aspera批量下载fastq或sra文件(EBI数据库)-香草杏仁

Aspera批量下载fastq或sra文件(EBI数据库)

本文介绍了如何通过Aspera工具批量下载EBI数据库中的fastq或sra文件。首先,用户需通过conda创建一个新的环境并安装Aspera CLI和sra-tools。在获取到目标文件的下载链接后,可以使用Aspera命令...
Vamond的头像-香草杏仁Vamond15天前
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生信分析环境搭建--conda+jupyter-香草杏仁

生信分析环境搭建–conda+jupyter

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