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linux常用命令:tar-香草杏仁

linux常用命令:tar

​​ Linux tar(英文全拼:tape archive )命令用于备份文件。 ​tar​是用来建立,还原备份文件的工具程序,它可以加入,解开备份文件内的文件。 备份文件不完全等同于压缩文件,linux中的备...
生信分析环境配置:conda-香草杏仁

生信分析环境配置:conda

最近由于CPU、内存等降价明显,自己配了一台洋垃圾,双路E5-2696V3, 36核72线程+128G内存,用来学习linux系统和生信分析,自己用目前是足够了,后续如果需求提高了可以升级到256G内存,目前一套...
conda的使用-香草杏仁

conda的使用

​​ conda的下载与安装 创建小环境并在其内安装软件 创建名为rna-seq​的小环境 # conda create -n [名称],后面是要安装的主要软件 conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y ...
使用Aspera高速下载ngs数据并进行MD5校验-香草杏仁

使用Aspera高速下载ngs数据并进行MD5校验

因为课题研究需要结合参考一篇已发表的单细胞数据,由于该文章只提供的原始fastq文件,所有要下载下来从上游分析开始做起。(如果是是做数据库生信挖掘的也需要下载文件哦)一开始尝试的使用htt...
Sortilin enhances fibrosis and calcification in aortic valve disease by inducing interstitial cell heterogeneity-香草杏仁

Sortilin enhances fibrosis and calcification in aortic valve disease by inducing interstitial cell heterogeneity

​​ 主要研究结果 SORT1与AS的遗传关联 ​​ 对SORT1基因组50kb范围的555个变体进行meta分析: 11个变体与AS显著相关,但可能仅包含一个独立的信号 ​​ sortlin缺失减弱主动脉瓣狭窄的发展并...
Resistin: Potential biomarker and therapeutic target in atherosclerosis-香草杏仁

Resistin: Potential biomarker and therapeutic target in atherosclerosis

Zhou, Li, Jun-Yi Li, Ping-Ping He, Xiao-Hua Yu, and Chao-Ke Tang. “Resistin: Potential Biomarker and Therapeutic Target in Atherosclerosis.” Clinica Chimica Acta; International J...
ubuntu 设置自动挂载磁盘-香草杏仁

ubuntu 设置自动挂载磁盘

系统:ubuntu20.04 创建挂载目录 sudo mkdir /mnt/data 磁盘查看磁盘信息 # 列出磁盘 lsblk # 查看磁盘UUID sudo blkid ### 输出中找到自己想挂载的磁盘,比如下面这个 ### /dev/sda1: LABEL='d...
linux中的usr和bin目录-香草杏仁

linux中的usr和bin目录

​​ 首先注意 usr 指 Unix System Resource​,而不是user /usr/bin​:系统预装的一些可执行程序,随系统升级会改变 ​/usr/local/bin​:用户安装的可执行程序,不受系统升级影响,用户编译...
linux常用命令: systemctl-香草杏仁

linux常用命令: systemctl

​​ linux系统结构/lib/systemd/system​目录 根据 Linux 惯例,字母d​是守护进程(daemon)的缩写。 Systemd 这个名字的含义,就是它要守护整个系统。 该目录自动存放启动文件的配置位置,里...
linux添加环境变量-香草杏仁

linux添加环境变量

"Linux笔记" ubuntu ​​ 在用户主目录下有一个 .bashrc 隐藏文件,可以在此文件中加入 PATH 的设置如下: sudo vim ~/.bashrc 加入: export PATH=<你的要加入的路径>:$PATH e...